Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
N4bp1Q6A037 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
N4bp1Q6A037 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
N4bp1Q6A037 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
N4bp1Q6A037 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
N4bp1Q6A037 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
N4bp1Q6A037 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
N4bp1Q6A037 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
N4bp1Q6A037 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4bp1Q6A037 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4bp1Q6A037 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4bp1Q6A037 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
N4bp1Q6A037 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
N4bp1Q6A037 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4bp1Q6A037 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4bp1Q6A037 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4bp1Q6A037 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4bp1Q6A037 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4bp1Q6A037 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4bp1Q6A037 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
N4bp1Q6A037 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
N4bp1Q6A037 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
N4bp1Q6A037 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
N4bp1Q6A037 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
N4bp1Q6A037 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
N4bp1Q6A037 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
N4bp1Q6A037 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
N4bp1Q6A037 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
N4bp1Q6A037 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
N4bp1Q6A037 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
N4bp1Q6A037 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
N4bp1Q6A037 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4bp1Q6A037 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4bp1Q6A037 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
N4bp1Q6A037 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4bp1Q6A037 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4bp1Q6A037 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4bp1Q6A037 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
N4bp1Q6A037 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
N4bp1Q6A037 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
N4bp1Q6A037 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
N4bp1Q6A037 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4bp1Q6A037 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4bp1Q6A037 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
N4bp1Q6A037 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
N4bp1Q6A037 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
N4bp1Q6A037 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4bp1Q6A037 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4bp1Q6A037 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4bp1Q6A037 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4bp1Q6A037 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4bp1Q6A037 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4bp1Q6A037 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4bp1Q6A037 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4bp1Q6A037 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4bp1Q6A037 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4bp1Q6A037 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4bp1Q6A037 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
N4bp1Q6A037 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4bp1Q6A037 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4bp1Q6A037 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4bp1Q6A037 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
N4bp1Q6A037 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
N4bp1Q6A037 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
N4bp1Q6A037 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4bp1Q6A037 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
N4bp1Q6A037 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
N4bp1Q6A037 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4bp1Q6A037 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
N4bp1Q6A037 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
N4bp1Q6A037 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
N4bp1Q6A037 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
N4bp1Q6A037 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
N4bp1Q6A037 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
N4bp1Q6A037 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
N4bp1Q6A037 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
N4bp1Q6A037 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4bp1Q6A037 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4bp1Q6A037 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
N4bp1Q6A037 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
N4bp1Q6A037 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
N4bp1Q6A037 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
N4bp1Q6A037 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4bp1Q6A037 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4bp1Q6A037 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4bp1Q6A037 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4bp1Q6A037 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4bp1Q6A037 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
N4bp1Q6A037 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
N4bp1Q6A037 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
N4bp1Q6A037 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
N4bp1Q6A037 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
N4bp1Q6A037 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
N4bp1Q6A037 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
N4bp1Q6A037 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4bp1Q6A037 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4bp1Q6A037 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4bp1Q6A037 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4bp1Q6A037 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4bp1Q6A037 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms