Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Cdk13Q69ZA1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Cdk13Q69ZA1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC38,18■■■■□ 3,7
Cdk13Q69ZA1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,17■■■■□ 3,7
Cdk13Q69ZA1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
Cdk13Q69ZA1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
Cdk13Q69ZA1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,02■■■■□ 3,68
Cdk13Q69ZA1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38,02■■■■□ 3,68
Cdk13Q69ZA1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38,02■■■■□ 3,68
Cdk13Q69ZA1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC38,01■■■■□ 3,67
Cdk13Q69ZA1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Cdk13Q69ZA1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37,97■■■■□ 3,67
Cdk13Q69ZA1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37,96■■■■□ 3,67
Cdk13Q69ZA1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,93■■■■□ 3,66
Cdk13Q69ZA1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Cdk13Q69ZA1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Cdk13Q69ZA1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37,92■■■■□ 3,66
Cdk13Q69ZA1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Cdk13Q69ZA1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC37,92■■■■□ 3,66
Cdk13Q69ZA1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Cdk13Q69ZA1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,87■■■■□ 3,65
Cdk13Q69ZA1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Cdk13Q69ZA1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Cdk13Q69ZA1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Cdk13Q69ZA1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37,84■■■■□ 3,65
Cdk13Q69ZA1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Cdk13Q69ZA1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Cdk13Q69ZA1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Cdk13Q69ZA1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
Cdk13Q69ZA1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
Cdk13Q69ZA1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Cdk13Q69ZA1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Cdk13Q69ZA1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37,77■■■■□ 3,64
Cdk13Q69ZA1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Cdk13Q69ZA1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Cdk13Q69ZA1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Cdk13Q69ZA1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37,74■■■■□ 3,63
Cdk13Q69ZA1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Cdk13Q69ZA1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Cdk13Q69ZA1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37,72■■■■□ 3,63
Cdk13Q69ZA1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,72■■■■□ 3,63
Cdk13Q69ZA1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Cdk13Q69ZA1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37,68■■■■□ 3,62
Cdk13Q69ZA1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37,66■■■■□ 3,62
Cdk13Q69ZA1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Cdk13Q69ZA1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Cdk13Q69ZA1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Cdk13Q69ZA1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Cdk13Q69ZA1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,61
Cdk13Q69ZA1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC37,55■■■■□ 3,6
Cdk13Q69ZA1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Cdk13Q69ZA1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Cdk13Q69ZA1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Cdk13Q69ZA1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Cdk13Q69ZA1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37,48■■■■□ 3,59
Cdk13Q69ZA1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37,47■■■■□ 3,59
Cdk13Q69ZA1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,46■■■■□ 3,59
Cdk13Q69ZA1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Cdk13Q69ZA1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Cdk13Q69ZA1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Cdk13Q69ZA1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37,42■■■■□ 3,58
Cdk13Q69ZA1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Cdk13Q69ZA1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Cdk13Q69ZA1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Cdk13Q69ZA1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Cdk13Q69ZA1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Cdk13Q69ZA1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,58
Cdk13Q69ZA1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Cdk13Q69ZA1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Cdk13Q69ZA1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37,38■■■■□ 3,57
Cdk13Q69ZA1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Cdk13Q69ZA1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Cdk13Q69ZA1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,33■■■■□ 3,57
Cdk13Q69ZA1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Cdk13Q69ZA1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37,31■■■■□ 3,56
Cdk13Q69ZA1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Cdk13Q69ZA1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Cdk13Q69ZA1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC37,26■■■■□ 3,55
Cdk13Q69ZA1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37,25■■■■□ 3,55
Cdk13Q69ZA1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Cdk13Q69ZA1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Cdk13Q69ZA1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Cdk13Q69ZA1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Cdk13Q69ZA1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37,22■■■■□ 3,55
Cdk13Q69ZA1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Cdk13Q69ZA1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Cdk13Q69ZA1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37,2■■■■□ 3,55
Cdk13Q69ZA1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Cdk13Q69ZA1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Cdk13Q69ZA1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,16■■■■□ 3,54
Cdk13Q69ZA1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Cdk13Q69ZA1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Cdk13Q69ZA1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Cdk13Q69ZA1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Cdk13Q69ZA1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Cdk13Q69ZA1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Cdk13Q69ZA1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Cdk13Q69ZA1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Cdk13Q69ZA1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC37,05■■■■□ 3,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50,9 ms