Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,7■■■■■ 4,27
Aebp1Q640N1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC41,7■■■■■ 4,27
Aebp1Q640N1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC41,7■■■■■ 4,27
Aebp1Q640N1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC41,69■■■■■ 4,26
Aebp1Q640N1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC41,67■■■■■ 4,26
Aebp1Q640N1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,67■■■■■ 4,26
Aebp1Q640N1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,65■■■■■ 4,26
Aebp1Q640N1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,64■■■■■ 4,26
Aebp1Q640N1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,62■■■■■ 4,25
Aebp1Q640N1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,62■■■■■ 4,25
Aebp1Q640N1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC41,61■■■■■ 4,25
Aebp1Q640N1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC41,57■■■■■ 4,25
Aebp1Q640N1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,57■■■■■ 4,25
Aebp1Q640N1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,55■■■■■ 4,24
Aebp1Q640N1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC41,55■■■■■ 4,24
Aebp1Q640N1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,54■■■■■ 4,24
Aebp1Q640N1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41,53■■■■■ 4,24
Aebp1Q640N1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,52■■■■■ 4,24
Aebp1Q640N1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC41,5■■■■■ 4,23
Aebp1Q640N1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Aebp1Q640N1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,44■■■■■ 4,22
Aebp1Q640N1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC41,42■■■■■ 4,22
Aebp1Q640N1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,21
Aebp1Q640N1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,34■■■■■ 4,21
Aebp1Q640N1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC41,3■■■■■ 4,2
Aebp1Q640N1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC41,25■■■■■ 4,19
Aebp1Q640N1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC41,23■■■■■ 4,19
Aebp1Q640N1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,23■■■■■ 4,19
Aebp1Q640N1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,21■■■■■ 4,19
Aebp1Q640N1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC41,21■■■■■ 4,19
Aebp1Q640N1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,19■■■■■ 4,18
Aebp1Q640N1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41,18■■■■■ 4,18
Aebp1Q640N1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41,13■■■■■ 4,18
Aebp1Q640N1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,13■■■■■ 4,17
Aebp1Q640N1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
Aebp1Q640N1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
Aebp1Q640N1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC41,12■■■■■ 4,17
Aebp1Q640N1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
Aebp1Q640N1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Aebp1Q640N1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Aebp1Q640N1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Aebp1Q640N1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41,08■■■■■ 4,17
Aebp1Q640N1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,17
Aebp1Q640N1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC41,06■■■■■ 4,16
Aebp1Q640N1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
Aebp1Q640N1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC41,02■■■■■ 4,16
Aebp1Q640N1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,99■■■■■ 4,15
Aebp1Q640N1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40,94■■■■■ 4,14
Aebp1Q640N1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,93■■■■■ 4,14
Aebp1Q640N1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Aebp1Q640N1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Aebp1Q640N1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,87■■■■■ 4,13
Aebp1Q640N1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC40,87■■■■■ 4,13
Aebp1Q640N1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
Aebp1Q640N1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
Aebp1Q640N1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Aebp1Q640N1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC40,85■■■■■ 4,13
Aebp1Q640N1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Aebp1Q640N1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,13
Aebp1Q640N1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,13
Aebp1Q640N1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
Aebp1Q640N1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Aebp1Q640N1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC40,79■■■■■ 4,12
Aebp1Q640N1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,79■■■■■ 4,12
Aebp1Q640N1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Aebp1Q640N1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC40,78■■■■■ 4,12
Aebp1Q640N1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,77■■■■■ 4,12
Aebp1Q640N1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40,76■■■■■ 4,12
Aebp1Q640N1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Aebp1Q640N1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC40,72■■■■■ 4,11
Aebp1Q640N1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Aebp1Q640N1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,69■■■■■ 4,1
Aebp1Q640N1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC40,68■■■■■ 4,1
Aebp1Q640N1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Aebp1Q640N1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,67■■■■■ 4,1
Aebp1Q640N1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Aebp1Q640N1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC40,62■■■■■ 4,09
Aebp1Q640N1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC40,61■■■■■ 4,09
Aebp1Q640N1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Aebp1Q640N1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Aebp1Q640N1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,08
Aebp1Q640N1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,57■■■■■ 4,08
Aebp1Q640N1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,08
Aebp1Q640N1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Aebp1Q640N1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Aebp1Q640N1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC40,52■■■■■ 4,08
Aebp1Q640N1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Aebp1Q640N1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Aebp1Q640N1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC40,5■■■■■ 4,07
Aebp1Q640N1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC40,49■■■■■ 4,07
Aebp1Q640N1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC40,49■■■■■ 4,07
Aebp1Q640N1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40,48■■■■■ 4,07
Aebp1Q640N1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
Aebp1Q640N1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC40,46■■■■■ 4,07
Aebp1Q640N1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,46■■■■■ 4,07
Aebp1Q640N1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Aebp1Q640N1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Aebp1Q640N1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Aebp1Q640N1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,4■■■■■ 4,06
Aebp1Q640N1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40,4■■■■■ 4,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,3 ms