Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Ccdc18Q640L5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Ccdc18Q640L5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Ccdc18Q640L5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Ccdc18Q640L5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
Ccdc18Q640L5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
Ccdc18Q640L5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
Ccdc18Q640L5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Ccdc18Q640L5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Ccdc18Q640L5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC44.77■■■■■ 4.76
Ccdc18Q640L5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Ccdc18Q640L5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
Ccdc18Q640L5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Ccdc18Q640L5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Ccdc18Q640L5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC44.71■■■■■ 4.75
Ccdc18Q640L5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC44.7■■■■■ 4.75
Ccdc18Q640L5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Ccdc18Q640L5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
Ccdc18Q640L5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Ccdc18Q640L5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Ccdc18Q640L5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Ccdc18Q640L5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Ccdc18Q640L5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Ccdc18Q640L5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Ccdc18Q640L5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Ccdc18Q640L5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
Ccdc18Q640L5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.72
Ccdc18Q640L5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
Ccdc18Q640L5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
Ccdc18Q640L5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Ccdc18Q640L5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Ccdc18Q640L5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
Ccdc18Q640L5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Ccdc18Q640L5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Ccdc18Q640L5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Ccdc18Q640L5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Ccdc18Q640L5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Ccdc18Q640L5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Ccdc18Q640L5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
Ccdc18Q640L5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Ccdc18Q640L5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Ccdc18Q640L5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Ccdc18Q640L5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Ccdc18Q640L5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Ccdc18Q640L5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Ccdc18Q640L5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Ccdc18Q640L5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Ccdc18Q640L5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Ccdc18Q640L5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.68
Ccdc18Q640L5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
Ccdc18Q640L5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
Ccdc18Q640L5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Ccdc18Q640L5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Ccdc18Q640L5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Ccdc18Q640L5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
Ccdc18Q640L5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
Ccdc18Q640L5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Ccdc18Q640L5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC44.12■■■■■ 4.65
Ccdc18Q640L5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Ccdc18Q640L5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
Ccdc18Q640L5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Ccdc18Q640L5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Ccdc18Q640L5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
Ccdc18Q640L5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Ccdc18Q640L5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Ccdc18Q640L5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Ccdc18Q640L5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Ccdc18Q640L5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Ccdc18Q640L5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
Ccdc18Q640L5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
Ccdc18Q640L5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
Ccdc18Q640L5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Ccdc18Q640L5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
Ccdc18Q640L5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
Ccdc18Q640L5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
Ccdc18Q640L5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Ccdc18Q640L5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Ccdc18Q640L5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Ccdc18Q640L5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
Ccdc18Q640L5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
Ccdc18Q640L5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
Ccdc18Q640L5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
Ccdc18Q640L5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Ccdc18Q640L5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Ccdc18Q640L5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
Ccdc18Q640L5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
Ccdc18Q640L5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Ccdc18Q640L5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Ccdc18Q640L5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Ccdc18Q640L5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Ccdc18Q640L5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Ccdc18Q640L5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Ccdc18Q640L5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
Ccdc18Q640L5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Ccdc18Q640L5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Ccdc18Q640L5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Ccdc18Q640L5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Ccdc18Q640L5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Ccdc18Q640L5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Ccdc18Q640L5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
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