Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
PatjQ63ZW7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,28■■■□□ 2,44
PatjQ63ZW7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
PatjQ63ZW7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
PatjQ63ZW7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
PatjQ63ZW7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
PatjQ63ZW7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
PatjQ63ZW7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
PatjQ63ZW7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
PatjQ63ZW7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
PatjQ63ZW7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,17■■■□□ 2,42
PatjQ63ZW7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
PatjQ63ZW7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
PatjQ63ZW7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
PatjQ63ZW7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
PatjQ63ZW7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,12■■■□□ 2,41
PatjQ63ZW7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
PatjQ63ZW7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30,09■■■□□ 2,41
PatjQ63ZW7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
PatjQ63ZW7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
PatjQ63ZW7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
PatjQ63ZW7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
PatjQ63ZW7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
PatjQ63ZW7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30,01■■■□□ 2,4
PatjQ63ZW7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
PatjQ63ZW7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
PatjQ63ZW7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
PatjQ63ZW7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2,39
PatjQ63ZW7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
PatjQ63ZW7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
PatjQ63ZW7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,94■■■□□ 2,38
PatjQ63ZW7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
PatjQ63ZW7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
PatjQ63ZW7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,91■■■□□ 2,38
PatjQ63ZW7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
PatjQ63ZW7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
PatjQ63ZW7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
PatjQ63ZW7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
PatjQ63ZW7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,83■■■□□ 2,37
PatjQ63ZW7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
PatjQ63ZW7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
PatjQ63ZW7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
PatjQ63ZW7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
PatjQ63ZW7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
PatjQ63ZW7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
PatjQ63ZW7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
PatjQ63ZW7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
PatjQ63ZW7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
PatjQ63ZW7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
PatjQ63ZW7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
PatjQ63ZW7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
PatjQ63ZW7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,69■■■□□ 2,34
PatjQ63ZW7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
PatjQ63ZW7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
PatjQ63ZW7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
PatjQ63ZW7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
PatjQ63ZW7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
PatjQ63ZW7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
PatjQ63ZW7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
PatjQ63ZW7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
PatjQ63ZW7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
PatjQ63ZW7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,62■■■□□ 2,33
PatjQ63ZW7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
PatjQ63ZW7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
PatjQ63ZW7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
PatjQ63ZW7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
PatjQ63ZW7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
PatjQ63ZW7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
PatjQ63ZW7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
PatjQ63ZW7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
PatjQ63ZW7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
PatjQ63ZW7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
PatjQ63ZW7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
PatjQ63ZW7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
PatjQ63ZW7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
PatjQ63ZW7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
PatjQ63ZW7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,32
PatjQ63ZW7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,48■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,47■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
PatjQ63ZW7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
PatjQ63ZW7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
PatjQ63ZW7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
PatjQ63ZW7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
PatjQ63ZW7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
PatjQ63ZW7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,39■■■□□ 2,29
PatjQ63ZW7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,37■■■□□ 2,29
PatjQ63ZW7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
PatjQ63ZW7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53,4 ms