Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
TrhQ62361 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,22■■■□□ 2,91
TrhQ62361 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
TrhQ62361 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
TrhQ62361 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
TrhQ62361 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
TrhQ62361 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
TrhQ62361 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,15■■■□□ 2,9
TrhQ62361 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
TrhQ62361 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
TrhQ62361 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33,14■■■□□ 2,9
TrhQ62361 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33,12■■■□□ 2,89
TrhQ62361 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
TrhQ62361 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
TrhQ62361 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33,08■■■□□ 2,89
TrhQ62361 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
TrhQ62361 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
TrhQ62361 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
TrhQ62361 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
TrhQ62361 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
TrhQ62361 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
TrhQ62361 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
TrhQ62361 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,01■■■□□ 2,87
TrhQ62361 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32,99■■■□□ 2,87
TrhQ62361 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
TrhQ62361 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32,97■■■□□ 2,87
TrhQ62361 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,96■■■□□ 2,87
TrhQ62361 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
TrhQ62361 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32,95■■■□□ 2,87
TrhQ62361 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
TrhQ62361 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
TrhQ62361 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,89■■■□□ 2,86
TrhQ62361 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
TrhQ62361 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
TrhQ62361 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
TrhQ62361 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
TrhQ62361 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32,87■■■□□ 2,85
TrhQ62361 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
TrhQ62361 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32,83■■■□□ 2,85
TrhQ62361 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
TrhQ62361 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
TrhQ62361 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
TrhQ62361 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
TrhQ62361 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32,79■■■□□ 2,84
TrhQ62361 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32,77■■■□□ 2,84
TrhQ62361 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
TrhQ62361 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,75■■■□□ 2,83
TrhQ62361 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
TrhQ62361 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
TrhQ62361 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
TrhQ62361 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32,74■■■□□ 2,83
TrhQ62361 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32,72■■■□□ 2,83
TrhQ62361 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,71■■■□□ 2,83
TrhQ62361 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32,7■■■□□ 2,83
TrhQ62361 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,65■■■□□ 2,82
TrhQ62361 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
TrhQ62361 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,64■■■□□ 2,82
TrhQ62361 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32,62■■■□□ 2,81
TrhQ62361 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32,62■■■□□ 2,81
TrhQ62361 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
TrhQ62361 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32,6■■■□□ 2,81
TrhQ62361 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32,57■■■□□ 2,8
TrhQ62361 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32,56■■■□□ 2,8
TrhQ62361 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
TrhQ62361 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
TrhQ62361 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,51■■■□□ 2,79
TrhQ62361 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32,5■■■□□ 2,79
TrhQ62361 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
TrhQ62361 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
TrhQ62361 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,46■■■□□ 2,79
TrhQ62361 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
TrhQ62361 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
TrhQ62361 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,43■■■□□ 2,78
TrhQ62361 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32,42■■■□□ 2,78
TrhQ62361 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
TrhQ62361 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
TrhQ62361 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
TrhQ62361 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32,39■■■□□ 2,78
TrhQ62361 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32,37■■■□□ 2,77
TrhQ62361 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
TrhQ62361 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
TrhQ62361 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
TrhQ62361 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
TrhQ62361 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
TrhQ62361 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
TrhQ62361 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
TrhQ62361 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,22■■■□□ 2,75
TrhQ62361 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
TrhQ62361 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
TrhQ62361 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
TrhQ62361 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
TrhQ62361 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,13■■■□□ 2,73
TrhQ62361 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
TrhQ62361 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32,09■■■□□ 2,73
TrhQ62361 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32,08■■■□□ 2,73
TrhQ62361 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
TrhQ62361 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
TrhQ62361 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
TrhQ62361 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
TrhQ62361 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms