Protein–RNA interactions for Protein: Q62283

Tspan7, Tetraspanin-7, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan7Q62283 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tspan7Q62283 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tspan7Q62283 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tspan7Q62283 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan7Q62283 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan7Q62283 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan7Q62283 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan7Q62283 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan7Q62283 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tspan7Q62283 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tspan7Q62283 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tspan7Q62283 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tspan7Q62283 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tspan7Q62283 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tspan7Q62283 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tspan7Q62283 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tspan7Q62283 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan7Q62283 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tspan7Q62283 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tspan7Q62283 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tspan7Q62283 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan7Q62283 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan7Q62283 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan7Q62283 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan7Q62283 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tspan7Q62283 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tspan7Q62283 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tspan7Q62283 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tspan7Q62283 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tspan7Q62283 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tspan7Q62283 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan7Q62283 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan7Q62283 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tspan7Q62283 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tspan7Q62283 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tspan7Q62283 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tspan7Q62283 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan7Q62283 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan7Q62283 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan7Q62283 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan7Q62283 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan7Q62283 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan7Q62283 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan7Q62283 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan7Q62283 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan7Q62283 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tspan7Q62283 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tspan7Q62283 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tspan7Q62283 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tspan7Q62283 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tspan7Q62283 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan7Q62283 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan7Q62283 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan7Q62283 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tspan7Q62283 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tspan7Q62283 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tspan7Q62283 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tspan7Q62283 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tspan7Q62283 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tspan7Q62283 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tspan7Q62283 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tspan7Q62283 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan7Q62283 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan7Q62283 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tspan7Q62283 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan7Q62283 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan7Q62283 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan7Q62283 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan7Q62283 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan7Q62283 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tspan7Q62283 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tspan7Q62283 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tspan7Q62283 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan7Q62283 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan7Q62283 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan7Q62283 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan7Q62283 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tspan7Q62283 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tspan7Q62283 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tspan7Q62283 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan7Q62283 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tspan7Q62283 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tspan7Q62283 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan7Q62283 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tspan7Q62283 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tspan7Q62283 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tspan7Q62283 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tspan7Q62283 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tspan7Q62283 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tspan7Q62283 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tspan7Q62283 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tspan7Q62283 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tspan7Q62283 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tspan7Q62283 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tspan7Q62283 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tspan7Q62283 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan7Q62283 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan7Q62283 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan7Q62283 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tspan7Q62283 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms