Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema3bQ62177 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sema3bQ62177 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema3bQ62177 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema3bQ62177 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema3bQ62177 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema3bQ62177 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3bQ62177 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema3bQ62177 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema3bQ62177 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema3bQ62177 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema3bQ62177 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema3bQ62177 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sema3bQ62177 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3bQ62177 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3bQ62177 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3bQ62177 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3bQ62177 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema3bQ62177 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema3bQ62177 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema3bQ62177 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sema3bQ62177 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sema3bQ62177 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3bQ62177 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3bQ62177 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema3bQ62177 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema3bQ62177 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema3bQ62177 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema3bQ62177 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema3bQ62177 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3bQ62177 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3bQ62177 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3bQ62177 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3bQ62177 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3bQ62177 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3bQ62177 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3bQ62177 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3bQ62177 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3bQ62177 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3bQ62177 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3bQ62177 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3bQ62177 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3bQ62177 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3bQ62177 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema3bQ62177 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema3bQ62177 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema3bQ62177 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema3bQ62177 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema3bQ62177 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema3bQ62177 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema3bQ62177 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema3bQ62177 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema3bQ62177 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema3bQ62177 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema3bQ62177 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sema3bQ62177 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema3bQ62177 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema3bQ62177 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema3bQ62177 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema3bQ62177 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema3bQ62177 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema3bQ62177 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema3bQ62177 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema3bQ62177 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema3bQ62177 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema3bQ62177 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema3bQ62177 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema3bQ62177 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema3bQ62177 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3bQ62177 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3bQ62177 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema3bQ62177 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema3bQ62177 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema3bQ62177 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3bQ62177 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3bQ62177 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema3bQ62177 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema3bQ62177 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3bQ62177 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3bQ62177 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3bQ62177 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3bQ62177 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3bQ62177 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3bQ62177 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3bQ62177 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3bQ62177 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3bQ62177 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3bQ62177 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema3bQ62177 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3bQ62177 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3bQ62177 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3bQ62177 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3bQ62177 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3bQ62177 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3bQ62177 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema3bQ62177 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema3bQ62177 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3bQ62177 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema3bQ62177 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3bQ62177 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms