Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbm38Q62176 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbm38Q62176 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm38Q62176 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm38Q62176 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm38Q62176 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms