Protein–RNA interactions for Protein: Q61493

Rev3l, DNA polymerase zeta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 3,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rev3lQ61493 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rev3lQ61493 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rev3lQ61493 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rev3lQ61493 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rev3lQ61493 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rev3lQ61493 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rev3lQ61493 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rev3lQ61493 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rev3lQ61493 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rev3lQ61493 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rev3lQ61493 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rev3lQ61493 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rev3lQ61493 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rev3lQ61493 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rev3lQ61493 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rev3lQ61493 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rev3lQ61493 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rev3lQ61493 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rev3lQ61493 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rev3lQ61493 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rev3lQ61493 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rev3lQ61493 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rev3lQ61493 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rev3lQ61493 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rev3lQ61493 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rev3lQ61493 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rev3lQ61493 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rev3lQ61493 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rev3lQ61493 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rev3lQ61493 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rev3lQ61493 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rev3lQ61493 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rev3lQ61493 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rev3lQ61493 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rev3lQ61493 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Rev3lQ61493 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rev3lQ61493 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rev3lQ61493 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rev3lQ61493 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rev3lQ61493 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rev3lQ61493 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rev3lQ61493 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rev3lQ61493 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rev3lQ61493 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rev3lQ61493 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rev3lQ61493 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rev3lQ61493 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rev3lQ61493 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rev3lQ61493 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rev3lQ61493 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rev3lQ61493 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rev3lQ61493 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rev3lQ61493 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rev3lQ61493 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rev3lQ61493 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rev3lQ61493 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rev3lQ61493 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rev3lQ61493 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rev3lQ61493 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rev3lQ61493 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rev3lQ61493 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rev3lQ61493 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rev3lQ61493 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rev3lQ61493 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rev3lQ61493 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rev3lQ61493 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rev3lQ61493 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rev3lQ61493 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rev3lQ61493 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rev3lQ61493 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rev3lQ61493 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rev3lQ61493 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rev3lQ61493 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rev3lQ61493 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rev3lQ61493 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rev3lQ61493 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rev3lQ61493 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rev3lQ61493 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rev3lQ61493 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rev3lQ61493 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rev3lQ61493 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rev3lQ61493 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rev3lQ61493 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rev3lQ61493 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rev3lQ61493 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rev3lQ61493 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rev3lQ61493 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rev3lQ61493 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rev3lQ61493 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rev3lQ61493 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rev3lQ61493 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rev3lQ61493 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rev3lQ61493 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rev3lQ61493 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rev3lQ61493 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rev3lQ61493 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rev3lQ61493 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rev3lQ61493 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rev3lQ61493 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rev3lQ61493 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms