Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1eQ61290 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1eQ61290 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1eQ61290 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacna1eQ61290 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacna1eQ61290 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna1eQ61290 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna1eQ61290 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna1eQ61290 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna1eQ61290 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacna1eQ61290 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna1eQ61290 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna1eQ61290 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacna1eQ61290 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna1eQ61290 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna1eQ61290 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacna1eQ61290 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacna1eQ61290 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacna1eQ61290 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna1eQ61290 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna1eQ61290 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacna1eQ61290 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna1eQ61290 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna1eQ61290 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1eQ61290 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1eQ61290 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1eQ61290 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna1eQ61290 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna1eQ61290 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacna1eQ61290 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1eQ61290 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1eQ61290 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1eQ61290 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1eQ61290 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1eQ61290 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacna1eQ61290 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1eQ61290 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Cacna1eQ61290 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna1eQ61290 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna1eQ61290 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna1eQ61290 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1eQ61290 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1eQ61290 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacna1eQ61290 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1eQ61290 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1eQ61290 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1eQ61290 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacna1eQ61290 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna1eQ61290 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna1eQ61290 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1eQ61290 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1eQ61290 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna1eQ61290 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1eQ61290 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1eQ61290 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1eQ61290 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1eQ61290 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1eQ61290 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1eQ61290 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1eQ61290 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1eQ61290 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1eQ61290 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacna1eQ61290 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1eQ61290 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacna1eQ61290 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacna1eQ61290 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacna1eQ61290 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacna1eQ61290 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacna1eQ61290 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacna1eQ61290 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1eQ61290 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1eQ61290 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1eQ61290 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1eQ61290 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1eQ61290 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1eQ61290 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1eQ61290 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1eQ61290 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1eQ61290 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1eQ61290 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1eQ61290 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1eQ61290 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1eQ61290 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1eQ61290 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cacna1eQ61290 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna1eQ61290 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna1eQ61290 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms