Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
TmpoQ61033 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,59■■■■□ 3,13
TmpoQ61033 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
TmpoQ61033 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34,56■■■■□ 3,12
TmpoQ61033 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
TmpoQ61033 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
TmpoQ61033 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
TmpoQ61033 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
TmpoQ61033 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
TmpoQ61033 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34,49■■■■□ 3,11
TmpoQ61033 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
TmpoQ61033 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
TmpoQ61033 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
TmpoQ61033 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
TmpoQ61033 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
TmpoQ61033 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
TmpoQ61033 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
TmpoQ61033 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
TmpoQ61033 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
TmpoQ61033 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,39■■■■□ 3,1
TmpoQ61033 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
TmpoQ61033 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
TmpoQ61033 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
TmpoQ61033 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
TmpoQ61033 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
TmpoQ61033 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34,27■■■■□ 3,08
TmpoQ61033 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34,26■■■■□ 3,08
TmpoQ61033 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
TmpoQ61033 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
TmpoQ61033 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,21■■■■□ 3,07
TmpoQ61033 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
TmpoQ61033 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
TmpoQ61033 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
TmpoQ61033 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
TmpoQ61033 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34,12■■■■□ 3,05
TmpoQ61033 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
TmpoQ61033 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34,11■■■■□ 3,05
TmpoQ61033 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
TmpoQ61033 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
TmpoQ61033 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34,07■■■■□ 3,04
TmpoQ61033 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34,06■■■■□ 3,04
TmpoQ61033 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
TmpoQ61033 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
TmpoQ61033 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
TmpoQ61033 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
TmpoQ61033 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
TmpoQ61033 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33,95■■■■□ 3,03
TmpoQ61033 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33,95■■■■□ 3,03
TmpoQ61033 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
TmpoQ61033 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,95■■■■□ 3,02
TmpoQ61033 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
TmpoQ61033 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
TmpoQ61033 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,89■■■■□ 3,02
TmpoQ61033 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
TmpoQ61033 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
TmpoQ61033 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33,87■■■■□ 3,01
TmpoQ61033 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
TmpoQ61033 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
TmpoQ61033 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
TmpoQ61033 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
TmpoQ61033 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
TmpoQ61033 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
TmpoQ61033 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
TmpoQ61033 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33,78■■■■□ 3
TmpoQ61033 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
TmpoQ61033 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,78■■■■□ 3
TmpoQ61033 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
TmpoQ61033 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33,77■■■■□ 3
TmpoQ61033 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
TmpoQ61033 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
TmpoQ61033 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
TmpoQ61033 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
TmpoQ61033 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
TmpoQ61033 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
TmpoQ61033 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33,67■■■□□ 2,98
TmpoQ61033 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
TmpoQ61033 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,66■■■□□ 2,98
TmpoQ61033 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
TmpoQ61033 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,65■■■□□ 2,98
TmpoQ61033 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
TmpoQ61033 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
TmpoQ61033 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
TmpoQ61033 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33,62■■■□□ 2,97
TmpoQ61033 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
TmpoQ61033 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
TmpoQ61033 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
TmpoQ61033 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
TmpoQ61033 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33,57■■■□□ 2,96
TmpoQ61033 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33,56■■■□□ 2,96
TmpoQ61033 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,55■■■□□ 2,96
TmpoQ61033 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,54■■■□□ 2,96
TmpoQ61033 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
TmpoQ61033 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
TmpoQ61033 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33,5■■■□□ 2,95
TmpoQ61033 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,49■■■□□ 2,95
TmpoQ61033 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
TmpoQ61033 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
TmpoQ61033 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
TmpoQ61033 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,46■■■□□ 2,95
TmpoQ61033 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms