Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tbc1d1Q60949 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tbc1d1Q60949 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tbc1d1Q60949 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tbc1d1Q60949 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tbc1d1Q60949 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tbc1d1Q60949 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tbc1d1Q60949 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tbc1d1Q60949 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tbc1d1Q60949 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tbc1d1Q60949 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tbc1d1Q60949 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tbc1d1Q60949 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tbc1d1Q60949 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tbc1d1Q60949 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tbc1d1Q60949 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tbc1d1Q60949 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tbc1d1Q60949 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tbc1d1Q60949 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tbc1d1Q60949 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tbc1d1Q60949 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tbc1d1Q60949 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tbc1d1Q60949 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tbc1d1Q60949 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tbc1d1Q60949 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tbc1d1Q60949 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tbc1d1Q60949 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tbc1d1Q60949 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tbc1d1Q60949 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tbc1d1Q60949 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tbc1d1Q60949 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tbc1d1Q60949 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tbc1d1Q60949 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tbc1d1Q60949 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tbc1d1Q60949 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tbc1d1Q60949 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tbc1d1Q60949 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tbc1d1Q60949 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tbc1d1Q60949 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tbc1d1Q60949 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tbc1d1Q60949 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tbc1d1Q60949 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tbc1d1Q60949 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tbc1d1Q60949 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tbc1d1Q60949 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tbc1d1Q60949 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tbc1d1Q60949 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tbc1d1Q60949 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tbc1d1Q60949 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tbc1d1Q60949 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tbc1d1Q60949 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tbc1d1Q60949 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tbc1d1Q60949 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tbc1d1Q60949 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tbc1d1Q60949 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tbc1d1Q60949 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tbc1d1Q60949 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tbc1d1Q60949 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tbc1d1Q60949 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tbc1d1Q60949 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tbc1d1Q60949 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tbc1d1Q60949 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Tbc1d1Q60949 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d1Q60949 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d1Q60949 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d1Q60949 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tbc1d1Q60949 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tbc1d1Q60949 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tbc1d1Q60949 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tbc1d1Q60949 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tbc1d1Q60949 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Tbc1d1Q60949 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Tbc1d1Q60949 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tbc1d1Q60949 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tbc1d1Q60949 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tbc1d1Q60949 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tbc1d1Q60949 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tbc1d1Q60949 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tbc1d1Q60949 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tbc1d1Q60949 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tbc1d1Q60949 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tbc1d1Q60949 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tbc1d1Q60949 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tbc1d1Q60949 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tbc1d1Q60949 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tbc1d1Q60949 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tbc1d1Q60949 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tbc1d1Q60949 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tbc1d1Q60949 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tbc1d1Q60949 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tbc1d1Q60949 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tbc1d1Q60949 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tbc1d1Q60949 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tbc1d1Q60949 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tbc1d1Q60949 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tbc1d1Q60949 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tbc1d1Q60949 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tbc1d1Q60949 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tbc1d1Q60949 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Tbc1d1Q60949 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms