Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctf1Q60753 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctf1Q60753 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctf1Q60753 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctf1Q60753 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctf1Q60753 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctf1Q60753 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctf1Q60753 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctf1Q60753 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctf1Q60753 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctf1Q60753 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctf1Q60753 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctf1Q60753 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctf1Q60753 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctf1Q60753 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctf1Q60753 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctf1Q60753 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctf1Q60753 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctf1Q60753 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctf1Q60753 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctf1Q60753 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctf1Q60753 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctf1Q60753 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctf1Q60753 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctf1Q60753 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctf1Q60753 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctf1Q60753 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctf1Q60753 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctf1Q60753 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctf1Q60753 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctf1Q60753 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctf1Q60753 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctf1Q60753 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctf1Q60753 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctf1Q60753 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctf1Q60753 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctf1Q60753 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctf1Q60753 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctf1Q60753 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctf1Q60753 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctf1Q60753 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctf1Q60753 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctf1Q60753 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctf1Q60753 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctf1Q60753 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctf1Q60753 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctf1Q60753 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctf1Q60753 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctf1Q60753 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctf1Q60753 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctf1Q60753 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctf1Q60753 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctf1Q60753 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctf1Q60753 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctf1Q60753 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctf1Q60753 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctf1Q60753 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctf1Q60753 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctf1Q60753 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctf1Q60753 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ctf1Q60753 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctf1Q60753 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctf1Q60753 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctf1Q60753 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctf1Q60753 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctf1Q60753 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctf1Q60753 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctf1Q60753 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctf1Q60753 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctf1Q60753 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctf1Q60753 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctf1Q60753 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctf1Q60753 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctf1Q60753 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctf1Q60753 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctf1Q60753 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctf1Q60753 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctf1Q60753 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctf1Q60753 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctf1Q60753 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctf1Q60753 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctf1Q60753 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctf1Q60753 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctf1Q60753 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctf1Q60753 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctf1Q60753 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms