Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Satb1Q60611 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Satb1Q60611 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Satb1Q60611 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Satb1Q60611 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Satb1Q60611 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Satb1Q60611 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Satb1Q60611 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Satb1Q60611 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Satb1Q60611 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Satb1Q60611 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Satb1Q60611 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Satb1Q60611 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Satb1Q60611 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Satb1Q60611 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Satb1Q60611 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Satb1Q60611 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Satb1Q60611 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Satb1Q60611 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Satb1Q60611 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Satb1Q60611 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Satb1Q60611 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Satb1Q60611 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Satb1Q60611 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Satb1Q60611 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Satb1Q60611 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Satb1Q60611 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
Satb1Q60611 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Satb1Q60611 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Satb1Q60611 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Satb1Q60611 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Satb1Q60611 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Satb1Q60611 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Satb1Q60611 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Satb1Q60611 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Satb1Q60611 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Satb1Q60611 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Satb1Q60611 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Satb1Q60611 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Satb1Q60611 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Satb1Q60611 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Satb1Q60611 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Satb1Q60611 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Satb1Q60611 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Satb1Q60611 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Satb1Q60611 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Satb1Q60611 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Satb1Q60611 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Satb1Q60611 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Satb1Q60611 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Satb1Q60611 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Satb1Q60611 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Satb1Q60611 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Satb1Q60611 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Satb1Q60611 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Satb1Q60611 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Satb1Q60611 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Satb1Q60611 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Satb1Q60611 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Satb1Q60611 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Satb1Q60611 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Satb1Q60611 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Satb1Q60611 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Satb1Q60611 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Satb1Q60611 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Satb1Q60611 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Satb1Q60611 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Satb1Q60611 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Satb1Q60611 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Satb1Q60611 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Satb1Q60611 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Satb1Q60611 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Satb1Q60611 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Satb1Q60611 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Satb1Q60611 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Satb1Q60611 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Satb1Q60611 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Satb1Q60611 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Satb1Q60611 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Satb1Q60611 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Satb1Q60611 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Satb1Q60611 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Satb1Q60611 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26,41■■□□□ 1,82
Satb1Q60611 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Satb1Q60611 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Satb1Q60611 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Satb1Q60611 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Satb1Q60611 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Satb1Q60611 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Satb1Q60611 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Satb1Q60611 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Satb1Q60611 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Satb1Q60611 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Satb1Q60611 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Satb1Q60611 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Satb1Q60611 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Satb1Q60611 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Satb1Q60611 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Satb1Q60611 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,23■■□□□ 1,79
Satb1Q60611 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,3 ms