Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Znrf3Q5SSZ7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Znrf3Q5SSZ7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znrf3Q5SSZ7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znrf3Q5SSZ7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Znrf3Q5SSZ7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Znrf3Q5SSZ7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Znrf3Q5SSZ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znrf3Q5SSZ7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znrf3Q5SSZ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znrf3Q5SSZ7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znrf3Q5SSZ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znrf3Q5SSZ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znrf3Q5SSZ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znrf3Q5SSZ7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Znrf3Q5SSZ7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znrf3Q5SSZ7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znrf3Q5SSZ7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znrf3Q5SSZ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znrf3Q5SSZ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znrf3Q5SSZ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Znrf3Q5SSZ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znrf3Q5SSZ7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znrf3Q5SSZ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Znrf3Q5SSZ7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znrf3Q5SSZ7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znrf3Q5SSZ7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znrf3Q5SSZ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znrf3Q5SSZ7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znrf3Q5SSZ7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znrf3Q5SSZ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znrf3Q5SSZ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znrf3Q5SSZ7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znrf3Q5SSZ7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znrf3Q5SSZ7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znrf3Q5SSZ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znrf3Q5SSZ7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Znrf3Q5SSZ7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Znrf3Q5SSZ7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Znrf3Q5SSZ7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Znrf3Q5SSZ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Znrf3Q5SSZ7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znrf3Q5SSZ7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znrf3Q5SSZ7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Znrf3Q5SSZ7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Znrf3Q5SSZ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Znrf3Q5SSZ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Znrf3Q5SSZ7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znrf3Q5SSZ7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znrf3Q5SSZ7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znrf3Q5SSZ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znrf3Q5SSZ7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znrf3Q5SSZ7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znrf3Q5SSZ7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Znrf3Q5SSZ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Znrf3Q5SSZ7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znrf3Q5SSZ7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znrf3Q5SSZ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Znrf3Q5SSZ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znrf3Q5SSZ7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Znrf3Q5SSZ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Znrf3Q5SSZ7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Znrf3Q5SSZ7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Znrf3Q5SSZ7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znrf3Q5SSZ7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znrf3Q5SSZ7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znrf3Q5SSZ7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Znrf3Q5SSZ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Znrf3Q5SSZ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znrf3Q5SSZ7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Znrf3Q5SSZ7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znrf3Q5SSZ7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znrf3Q5SSZ7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znrf3Q5SSZ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znrf3Q5SSZ7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znrf3Q5SSZ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Znrf3Q5SSZ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znrf3Q5SSZ7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znrf3Q5SSZ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znrf3Q5SSZ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Znrf3Q5SSZ7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znrf3Q5SSZ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Znrf3Q5SSZ7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znrf3Q5SSZ7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znrf3Q5SSZ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znrf3Q5SSZ7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znrf3Q5SSZ7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znrf3Q5SSZ7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Znrf3Q5SSZ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znrf3Q5SSZ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Znrf3Q5SSZ7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znrf3Q5SSZ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znrf3Q5SSZ7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Znrf3Q5SSZ7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Znrf3Q5SSZ7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Znrf3Q5SSZ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Znrf3Q5SSZ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms