Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ccdc88aQ5SNZ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc88aQ5SNZ0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc88aQ5SNZ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc88aQ5SNZ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc88aQ5SNZ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc88aQ5SNZ0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc88aQ5SNZ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc88aQ5SNZ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc88aQ5SNZ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc88aQ5SNZ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc88aQ5SNZ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccdc88aQ5SNZ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc88aQ5SNZ0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms