Protein–RNA interactions for Protein: Q5IRJ6

Slc30a9, Zinc transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a9Q5IRJ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc30a9Q5IRJ6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc30a9Q5IRJ6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc30a9Q5IRJ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc30a9Q5IRJ6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc30a9Q5IRJ6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc30a9Q5IRJ6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc30a9Q5IRJ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc30a9Q5IRJ6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc30a9Q5IRJ6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc30a9Q5IRJ6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc30a9Q5IRJ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc30a9Q5IRJ6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc30a9Q5IRJ6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc30a9Q5IRJ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc30a9Q5IRJ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc30a9Q5IRJ6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc30a9Q5IRJ6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc30a9Q5IRJ6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc30a9Q5IRJ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc30a9Q5IRJ6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc30a9Q5IRJ6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc30a9Q5IRJ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc30a9Q5IRJ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc30a9Q5IRJ6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc30a9Q5IRJ6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc30a9Q5IRJ6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc30a9Q5IRJ6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc30a9Q5IRJ6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc30a9Q5IRJ6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc30a9Q5IRJ6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc30a9Q5IRJ6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc30a9Q5IRJ6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc30a9Q5IRJ6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc30a9Q5IRJ6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc30a9Q5IRJ6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc30a9Q5IRJ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc30a9Q5IRJ6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc30a9Q5IRJ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc30a9Q5IRJ6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc30a9Q5IRJ6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc30a9Q5IRJ6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc30a9Q5IRJ6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc30a9Q5IRJ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc30a9Q5IRJ6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc30a9Q5IRJ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc30a9Q5IRJ6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc30a9Q5IRJ6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc30a9Q5IRJ6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc30a9Q5IRJ6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc30a9Q5IRJ6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc30a9Q5IRJ6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc30a9Q5IRJ6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slc30a9Q5IRJ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc30a9Q5IRJ6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc30a9Q5IRJ6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc30a9Q5IRJ6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc30a9Q5IRJ6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc30a9Q5IRJ6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc30a9Q5IRJ6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc30a9Q5IRJ6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc30a9Q5IRJ6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc30a9Q5IRJ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc30a9Q5IRJ6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc30a9Q5IRJ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc30a9Q5IRJ6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc30a9Q5IRJ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc30a9Q5IRJ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc30a9Q5IRJ6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc30a9Q5IRJ6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc30a9Q5IRJ6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc30a9Q5IRJ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc30a9Q5IRJ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc30a9Q5IRJ6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc30a9Q5IRJ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc30a9Q5IRJ6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc30a9Q5IRJ6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc30a9Q5IRJ6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc30a9Q5IRJ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc30a9Q5IRJ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc30a9Q5IRJ6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc30a9Q5IRJ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc30a9Q5IRJ6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc30a9Q5IRJ6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms