Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
DroshaQ5HZJ0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
DroshaQ5HZJ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
DroshaQ5HZJ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
DroshaQ5HZJ0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
DroshaQ5HZJ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
DroshaQ5HZJ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
DroshaQ5HZJ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
DroshaQ5HZJ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
DroshaQ5HZJ0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
DroshaQ5HZJ0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
DroshaQ5HZJ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
DroshaQ5HZJ0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
DroshaQ5HZJ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
DroshaQ5HZJ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
DroshaQ5HZJ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
DroshaQ5HZJ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
DroshaQ5HZJ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
DroshaQ5HZJ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
DroshaQ5HZJ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
DroshaQ5HZJ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
DroshaQ5HZJ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
DroshaQ5HZJ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
DroshaQ5HZJ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
DroshaQ5HZJ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
DroshaQ5HZJ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
DroshaQ5HZJ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
DroshaQ5HZJ0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
DroshaQ5HZJ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
DroshaQ5HZJ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
DroshaQ5HZJ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
DroshaQ5HZJ0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
DroshaQ5HZJ0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
DroshaQ5HZJ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
DroshaQ5HZJ0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
DroshaQ5HZJ0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
DroshaQ5HZJ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
DroshaQ5HZJ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
DroshaQ5HZJ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
DroshaQ5HZJ0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
DroshaQ5HZJ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
DroshaQ5HZJ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
DroshaQ5HZJ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
DroshaQ5HZJ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
DroshaQ5HZJ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
DroshaQ5HZJ0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
DroshaQ5HZJ0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
DroshaQ5HZJ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
DroshaQ5HZJ0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
DroshaQ5HZJ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
DroshaQ5HZJ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
DroshaQ5HZJ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
DroshaQ5HZJ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
DroshaQ5HZJ0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
DroshaQ5HZJ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
DroshaQ5HZJ0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
DroshaQ5HZJ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
DroshaQ5HZJ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
DroshaQ5HZJ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
DroshaQ5HZJ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
DroshaQ5HZJ0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
DroshaQ5HZJ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
DroshaQ5HZJ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
DroshaQ5HZJ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
DroshaQ5HZJ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
DroshaQ5HZJ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
DroshaQ5HZJ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
DroshaQ5HZJ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
DroshaQ5HZJ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
DroshaQ5HZJ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
DroshaQ5HZJ0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
DroshaQ5HZJ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
DroshaQ5HZJ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
DroshaQ5HZJ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
DroshaQ5HZJ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
DroshaQ5HZJ0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
DroshaQ5HZJ0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
DroshaQ5HZJ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
DroshaQ5HZJ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
DroshaQ5HZJ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
DroshaQ5HZJ0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
DroshaQ5HZJ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
DroshaQ5HZJ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
DroshaQ5HZJ0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
DroshaQ5HZJ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
DroshaQ5HZJ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
DroshaQ5HZJ0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
DroshaQ5HZJ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
DroshaQ5HZJ0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
DroshaQ5HZJ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
DroshaQ5HZJ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
DroshaQ5HZJ0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
DroshaQ5HZJ0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
DroshaQ5HZJ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
DroshaQ5HZJ0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
DroshaQ5HZJ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
DroshaQ5HZJ0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
DroshaQ5HZJ0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
DroshaQ5HZJ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
DroshaQ5HZJ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms