Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rtl5Q5DTT4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rtl5Q5DTT4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rtl5Q5DTT4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rtl5Q5DTT4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rtl5Q5DTT4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rtl5Q5DTT4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rtl5Q5DTT4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Rtl5Q5DTT4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rtl5Q5DTT4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rtl5Q5DTT4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rtl5Q5DTT4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Rtl5Q5DTT4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rtl5Q5DTT4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rtl5Q5DTT4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Rtl5Q5DTT4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rtl5Q5DTT4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rtl5Q5DTT4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rtl5Q5DTT4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rtl5Q5DTT4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rtl5Q5DTT4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rtl5Q5DTT4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rtl5Q5DTT4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rtl5Q5DTT4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rtl5Q5DTT4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rtl5Q5DTT4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rtl5Q5DTT4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rtl5Q5DTT4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rtl5Q5DTT4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rtl5Q5DTT4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rtl5Q5DTT4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rtl5Q5DTT4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rtl5Q5DTT4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rtl5Q5DTT4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rtl5Q5DTT4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rtl5Q5DTT4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rtl5Q5DTT4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rtl5Q5DTT4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rtl5Q5DTT4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Rtl5Q5DTT4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rtl5Q5DTT4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rtl5Q5DTT4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rtl5Q5DTT4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Rtl5Q5DTT4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Rtl5Q5DTT4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rtl5Q5DTT4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rtl5Q5DTT4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rtl5Q5DTT4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rtl5Q5DTT4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rtl5Q5DTT4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rtl5Q5DTT4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rtl5Q5DTT4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rtl5Q5DTT4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Rtl5Q5DTT4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rtl5Q5DTT4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rtl5Q5DTT4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rtl5Q5DTT4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rtl5Q5DTT4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rtl5Q5DTT4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rtl5Q5DTT4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rtl5Q5DTT4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rtl5Q5DTT4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rtl5Q5DTT4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rtl5Q5DTT4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rtl5Q5DTT4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rtl5Q5DTT4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rtl5Q5DTT4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rtl5Q5DTT4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Rtl5Q5DTT4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rtl5Q5DTT4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rtl5Q5DTT4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rtl5Q5DTT4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rtl5Q5DTT4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rtl5Q5DTT4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rtl5Q5DTT4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rtl5Q5DTT4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rtl5Q5DTT4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rtl5Q5DTT4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rtl5Q5DTT4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rtl5Q5DTT4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rtl5Q5DTT4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rtl5Q5DTT4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rtl5Q5DTT4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rtl5Q5DTT4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rtl5Q5DTT4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rtl5Q5DTT4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rtl5Q5DTT4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rtl5Q5DTT4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rtl5Q5DTT4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rtl5Q5DTT4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rtl5Q5DTT4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rtl5Q5DTT4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rtl5Q5DTT4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rtl5Q5DTT4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
Rtl5Q5DTT4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rtl5Q5DTT4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rtl5Q5DTT4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rtl5Q5DTT4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rtl5Q5DTT4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms