Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2cd3Q52KB6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2cd3Q52KB6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2cd3Q52KB6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2cd3Q52KB6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2cd3Q52KB6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2cd3Q52KB6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C2cd3Q52KB6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C2cd3Q52KB6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C2cd3Q52KB6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C2cd3Q52KB6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2cd3Q52KB6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2cd3Q52KB6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2cd3Q52KB6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2cd3Q52KB6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C2cd3Q52KB6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2cd3Q52KB6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2cd3Q52KB6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2cd3Q52KB6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2cd3Q52KB6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2cd3Q52KB6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2cd3Q52KB6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
C2cd3Q52KB6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2cd3Q52KB6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2cd3Q52KB6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2cd3Q52KB6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2cd3Q52KB6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C2cd3Q52KB6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2cd3Q52KB6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2cd3Q52KB6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C2cd3Q52KB6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2cd3Q52KB6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2cd3Q52KB6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C2cd3Q52KB6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2cd3Q52KB6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2cd3Q52KB6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2cd3Q52KB6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2cd3Q52KB6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2cd3Q52KB6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C2cd3Q52KB6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2cd3Q52KB6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2cd3Q52KB6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2cd3Q52KB6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2cd3Q52KB6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2cd3Q52KB6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C2cd3Q52KB6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C2cd3Q52KB6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2cd3Q52KB6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2cd3Q52KB6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2cd3Q52KB6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C2cd3Q52KB6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C2cd3Q52KB6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2cd3Q52KB6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C2cd3Q52KB6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2cd3Q52KB6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2cd3Q52KB6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2cd3Q52KB6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2cd3Q52KB6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2cd3Q52KB6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2cd3Q52KB6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2cd3Q52KB6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2cd3Q52KB6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2cd3Q52KB6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2cd3Q52KB6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2cd3Q52KB6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2cd3Q52KB6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2cd3Q52KB6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2cd3Q52KB6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2cd3Q52KB6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C2cd3Q52KB6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2cd3Q52KB6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2cd3Q52KB6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2cd3Q52KB6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2cd3Q52KB6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2cd3Q52KB6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2cd3Q52KB6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2cd3Q52KB6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C2cd3Q52KB6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2cd3Q52KB6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2cd3Q52KB6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2cd3Q52KB6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd3Q52KB6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd3Q52KB6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd3Q52KB6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd3Q52KB6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd3Q52KB6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2cd3Q52KB6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C2cd3Q52KB6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2cd3Q52KB6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2cd3Q52KB6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2cd3Q52KB6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2cd3Q52KB6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2cd3Q52KB6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2cd3Q52KB6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2cd3Q52KB6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2cd3Q52KB6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd3Q52KB6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd3Q52KB6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms