Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2al1nQ497L1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2al1nQ497L1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2al1nQ497L1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2al1nQ497L1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2al1nQ497L1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2al1nQ497L1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2al1nQ497L1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2al1nQ497L1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2al1nQ497L1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2al1nQ497L1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2al1nQ497L1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2al1nQ497L1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
H2al1nQ497L1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2al1nQ497L1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
H2al1nQ497L1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
H2al1nQ497L1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2al1nQ497L1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2al1nQ497L1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2al1nQ497L1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2al1nQ497L1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
H2al1nQ497L1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2al1nQ497L1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2al1nQ497L1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
H2al1nQ497L1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2al1nQ497L1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2al1nQ497L1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2al1nQ497L1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2al1nQ497L1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2al1nQ497L1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2al1nQ497L1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2al1nQ497L1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2al1nQ497L1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2al1nQ497L1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2al1nQ497L1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2al1nQ497L1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2al1nQ497L1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2al1nQ497L1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2al1nQ497L1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2al1nQ497L1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2al1nQ497L1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2al1nQ497L1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2al1nQ497L1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
H2al1nQ497L1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2al1nQ497L1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2al1nQ497L1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2al1nQ497L1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2al1nQ497L1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2al1nQ497L1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2al1nQ497L1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2al1nQ497L1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2al1nQ497L1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2al1nQ497L1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2al1nQ497L1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2al1nQ497L1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2al1nQ497L1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2al1nQ497L1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2al1nQ497L1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2al1nQ497L1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2al1nQ497L1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2al1nQ497L1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2al1nQ497L1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2al1nQ497L1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2al1nQ497L1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2al1nQ497L1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2al1nQ497L1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2al1nQ497L1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2al1nQ497L1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2al1nQ497L1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2al1nQ497L1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2al1nQ497L1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2al1nQ497L1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2al1nQ497L1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2al1nQ497L1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2al1nQ497L1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2al1nQ497L1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2al1nQ497L1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2al1nQ497L1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al1nQ497L1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2al1nQ497L1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2al1nQ497L1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2al1nQ497L1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2al1nQ497L1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2al1nQ497L1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2al1nQ497L1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms