Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2K7

1700123L14Rik, RIKEN cDNA 1700123L14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123L14RikQ3V2K7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
1700123L14RikQ3V2K7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
1700123L14RikQ3V2K7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
1700123L14RikQ3V2K7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
1700123L14RikQ3V2K7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
1700123L14RikQ3V2K7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
1700123L14RikQ3V2K7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
1700123L14RikQ3V2K7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
1700123L14RikQ3V2K7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
1700123L14RikQ3V2K7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
1700123L14RikQ3V2K7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
1700123L14RikQ3V2K7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
1700123L14RikQ3V2K7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
1700123L14RikQ3V2K7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
1700123L14RikQ3V2K7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
1700123L14RikQ3V2K7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
1700123L14RikQ3V2K7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
1700123L14RikQ3V2K7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
1700123L14RikQ3V2K7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
1700123L14RikQ3V2K7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
1700123L14RikQ3V2K7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
1700123L14RikQ3V2K7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
1700123L14RikQ3V2K7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
1700123L14RikQ3V2K7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
1700123L14RikQ3V2K7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
1700123L14RikQ3V2K7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
1700123L14RikQ3V2K7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
1700123L14RikQ3V2K7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
1700123L14RikQ3V2K7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
1700123L14RikQ3V2K7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
1700123L14RikQ3V2K7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
1700123L14RikQ3V2K7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
1700123L14RikQ3V2K7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
1700123L14RikQ3V2K7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
1700123L14RikQ3V2K7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
1700123L14RikQ3V2K7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
1700123L14RikQ3V2K7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
1700123L14RikQ3V2K7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
1700123L14RikQ3V2K7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
1700123L14RikQ3V2K7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
1700123L14RikQ3V2K7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
1700123L14RikQ3V2K7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
1700123L14RikQ3V2K7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
1700123L14RikQ3V2K7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
1700123L14RikQ3V2K7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
1700123L14RikQ3V2K7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
1700123L14RikQ3V2K7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
1700123L14RikQ3V2K7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
1700123L14RikQ3V2K7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
1700123L14RikQ3V2K7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
1700123L14RikQ3V2K7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
1700123L14RikQ3V2K7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
1700123L14RikQ3V2K7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
1700123L14RikQ3V2K7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
1700123L14RikQ3V2K7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
1700123L14RikQ3V2K7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
1700123L14RikQ3V2K7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
1700123L14RikQ3V2K7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
1700123L14RikQ3V2K7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
1700123L14RikQ3V2K7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
1700123L14RikQ3V2K7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
1700123L14RikQ3V2K7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
1700123L14RikQ3V2K7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
1700123L14RikQ3V2K7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
1700123L14RikQ3V2K7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
1700123L14RikQ3V2K7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
1700123L14RikQ3V2K7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
1700123L14RikQ3V2K7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
1700123L14RikQ3V2K7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
1700123L14RikQ3V2K7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
1700123L14RikQ3V2K7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
1700123L14RikQ3V2K7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
1700123L14RikQ3V2K7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
1700123L14RikQ3V2K7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
1700123L14RikQ3V2K7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
1700123L14RikQ3V2K7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
1700123L14RikQ3V2K7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
1700123L14RikQ3V2K7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
1700123L14RikQ3V2K7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
1700123L14RikQ3V2K7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
1700123L14RikQ3V2K7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
1700123L14RikQ3V2K7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
1700123L14RikQ3V2K7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
1700123L14RikQ3V2K7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
1700123L14RikQ3V2K7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
1700123L14RikQ3V2K7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
1700123L14RikQ3V2K7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
1700123L14RikQ3V2K7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
1700123L14RikQ3V2K7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
1700123L14RikQ3V2K7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
1700123L14RikQ3V2K7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
1700123L14RikQ3V2K7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
1700123L14RikQ3V2K7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
1700123L14RikQ3V2K7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
1700123L14RikQ3V2K7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
1700123L14RikQ3V2K7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
1700123L14RikQ3V2K7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
1700123L14RikQ3V2K7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
1700123L14RikQ3V2K7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
1700123L14RikQ3V2K7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms