Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmub2Q3V209 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmub2Q3V209 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmub2Q3V209 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmub2Q3V209 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmub2Q3V209 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmub2Q3V209 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmub2Q3V209 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmub2Q3V209 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmub2Q3V209 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmub2Q3V209 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmub2Q3V209 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmub2Q3V209 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmub2Q3V209 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmub2Q3V209 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmub2Q3V209 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmub2Q3V209 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmub2Q3V209 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmub2Q3V209 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmub2Q3V209 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmub2Q3V209 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmub2Q3V209 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmub2Q3V209 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmub2Q3V209 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmub2Q3V209 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmub2Q3V209 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmub2Q3V209 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmub2Q3V209 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmub2Q3V209 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmub2Q3V209 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmub2Q3V209 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmub2Q3V209 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmub2Q3V209 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmub2Q3V209 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmub2Q3V209 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmub2Q3V209 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmub2Q3V209 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmub2Q3V209 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmub2Q3V209 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmub2Q3V209 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmub2Q3V209 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmub2Q3V209 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmub2Q3V209 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmub2Q3V209 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmub2Q3V209 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmub2Q3V209 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmub2Q3V209 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmub2Q3V209 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmub2Q3V209 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmub2Q3V209 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmub2Q3V209 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmub2Q3V209 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmub2Q3V209 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmub2Q3V209 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmub2Q3V209 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmub2Q3V209 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmub2Q3V209 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmub2Q3V209 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmub2Q3V209 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmub2Q3V209 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmub2Q3V209 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmub2Q3V209 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmub2Q3V209 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmub2Q3V209 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmub2Q3V209 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmub2Q3V209 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmub2Q3V209 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmub2Q3V209 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmub2Q3V209 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmub2Q3V209 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmub2Q3V209 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmub2Q3V209 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmub2Q3V209 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmub2Q3V209 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmub2Q3V209 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmub2Q3V209 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmub2Q3V209 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmub2Q3V209 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmub2Q3V209 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmub2Q3V209 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmub2Q3V209 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmub2Q3V209 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmub2Q3V209 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmub2Q3V209 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms