Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Ldlrad2Q3V0V0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ldlrad2Q3V0V0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ldlrad2Q3V0V0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ldlrad2Q3V0V0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ldlrad2Q3V0V0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ldlrad2Q3V0V0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ldlrad2Q3V0V0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Ldlrad2Q3V0V0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Ldlrad2Q3V0V0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Ldlrad2Q3V0V0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ldlrad2Q3V0V0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ldlrad2Q3V0V0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ldlrad2Q3V0V0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ldlrad2Q3V0V0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ldlrad2Q3V0V0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ldlrad2Q3V0V0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ldlrad2Q3V0V0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ldlrad2Q3V0V0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ldlrad2Q3V0V0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ldlrad2Q3V0V0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ldlrad2Q3V0V0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Ldlrad2Q3V0V0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ldlrad2Q3V0V0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ldlrad2Q3V0V0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ldlrad2Q3V0V0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Ldlrad2Q3V0V0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Ldlrad2Q3V0V0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20,77■□□□□ 0,92
Ldlrad2Q3V0V0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Ldlrad2Q3V0V0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Ldlrad2Q3V0V0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Ldlrad2Q3V0V0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Ldlrad2Q3V0V0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Ldlrad2Q3V0V0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Ldlrad2Q3V0V0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Ldlrad2Q3V0V0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Ldlrad2Q3V0V0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Ldlrad2Q3V0V0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Ldlrad2Q3V0V0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Ldlrad2Q3V0V0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Ldlrad2Q3V0V0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Ldlrad2Q3V0V0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20,7■□□□□ 0,9
Ldlrad2Q3V0V0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ldlrad2Q3V0V0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ldlrad2Q3V0V0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ldlrad2Q3V0V0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20,66■□□□□ 0,9
Ldlrad2Q3V0V0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Ldlrad2Q3V0V0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Ldlrad2Q3V0V0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Ldlrad2Q3V0V0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Ldlrad2Q3V0V0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Ldlrad2Q3V0V0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Ldlrad2Q3V0V0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Ldlrad2Q3V0V0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ldlrad2Q3V0V0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Ldlrad2Q3V0V0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20,61■□□□□ 0,89
Ldlrad2Q3V0V0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Ldlrad2Q3V0V0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20,59■□□□□ 0,89
Ldlrad2Q3V0V0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Ldlrad2Q3V0V0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20,54■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Ldlrad2Q3V0V0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ldlrad2Q3V0V0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ldlrad2Q3V0V0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ldlrad2Q3V0V0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ldlrad2Q3V0V0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ldlrad2Q3V0V0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ldlrad2Q3V0V0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ldlrad2Q3V0V0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ldlrad2Q3V0V0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ldlrad2Q3V0V0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ldlrad2Q3V0V0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ldlrad2Q3V0V0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ldlrad2Q3V0V0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ldlrad2Q3V0V0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ldlrad2Q3V0V0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ldlrad2Q3V0V0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Ldlrad2Q3V0V0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Ldlrad2Q3V0V0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Ldlrad2Q3V0V0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Ldlrad2Q3V0V0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Ldlrad2Q3V0V0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms