Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc160Q3UYG1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc160Q3UYG1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc160Q3UYG1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc160Q3UYG1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc160Q3UYG1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc160Q3UYG1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc160Q3UYG1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc160Q3UYG1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc160Q3UYG1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc160Q3UYG1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc160Q3UYG1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc160Q3UYG1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc160Q3UYG1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc160Q3UYG1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc160Q3UYG1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc160Q3UYG1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc160Q3UYG1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc160Q3UYG1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc160Q3UYG1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc160Q3UYG1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc160Q3UYG1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc160Q3UYG1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc160Q3UYG1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc160Q3UYG1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc160Q3UYG1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc160Q3UYG1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc160Q3UYG1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc160Q3UYG1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc160Q3UYG1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc160Q3UYG1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc160Q3UYG1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc160Q3UYG1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc160Q3UYG1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc160Q3UYG1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc160Q3UYG1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc160Q3UYG1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc160Q3UYG1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc160Q3UYG1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc160Q3UYG1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc160Q3UYG1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc160Q3UYG1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc160Q3UYG1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc160Q3UYG1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc160Q3UYG1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc160Q3UYG1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc160Q3UYG1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc160Q3UYG1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc160Q3UYG1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc160Q3UYG1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc160Q3UYG1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc160Q3UYG1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc160Q3UYG1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc160Q3UYG1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc160Q3UYG1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc160Q3UYG1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc160Q3UYG1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc160Q3UYG1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc160Q3UYG1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc160Q3UYG1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc160Q3UYG1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc160Q3UYG1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc160Q3UYG1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc160Q3UYG1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc160Q3UYG1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc160Q3UYG1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc160Q3UYG1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc160Q3UYG1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc160Q3UYG1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc160Q3UYG1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc160Q3UYG1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc160Q3UYG1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc160Q3UYG1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc160Q3UYG1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc160Q3UYG1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc160Q3UYG1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc160Q3UYG1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc160Q3UYG1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc160Q3UYG1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc160Q3UYG1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc160Q3UYG1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc160Q3UYG1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc160Q3UYG1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc160Q3UYG1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc160Q3UYG1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc160Q3UYG1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc160Q3UYG1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc160Q3UYG1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc160Q3UYG1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc160Q3UYG1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc160Q3UYG1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc160Q3UYG1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc160Q3UYG1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc160Q3UYG1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc160Q3UYG1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc160Q3UYG1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc160Q3UYG1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc160Q3UYG1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms