Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A530084C06RikQ3UTW2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A530084C06RikQ3UTW2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A530084C06RikQ3UTW2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A530084C06RikQ3UTW2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A530084C06RikQ3UTW2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A530084C06RikQ3UTW2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A530084C06RikQ3UTW2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A530084C06RikQ3UTW2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A530084C06RikQ3UTW2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A530084C06RikQ3UTW2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A530084C06RikQ3UTW2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A530084C06RikQ3UTW2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A530084C06RikQ3UTW2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A530084C06RikQ3UTW2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A530084C06RikQ3UTW2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A530084C06RikQ3UTW2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A530084C06RikQ3UTW2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A530084C06RikQ3UTW2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A530084C06RikQ3UTW2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A530084C06RikQ3UTW2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A530084C06RikQ3UTW2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A530084C06RikQ3UTW2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A530084C06RikQ3UTW2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A530084C06RikQ3UTW2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A530084C06RikQ3UTW2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A530084C06RikQ3UTW2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A530084C06RikQ3UTW2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A530084C06RikQ3UTW2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A530084C06RikQ3UTW2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A530084C06RikQ3UTW2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
A530084C06RikQ3UTW2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A530084C06RikQ3UTW2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A530084C06RikQ3UTW2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A530084C06RikQ3UTW2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A530084C06RikQ3UTW2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A530084C06RikQ3UTW2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
A530084C06RikQ3UTW2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A530084C06RikQ3UTW2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A530084C06RikQ3UTW2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A530084C06RikQ3UTW2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A530084C06RikQ3UTW2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A530084C06RikQ3UTW2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A530084C06RikQ3UTW2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A530084C06RikQ3UTW2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A530084C06RikQ3UTW2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A530084C06RikQ3UTW2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A530084C06RikQ3UTW2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A530084C06RikQ3UTW2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A530084C06RikQ3UTW2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
A530084C06RikQ3UTW2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
A530084C06RikQ3UTW2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A530084C06RikQ3UTW2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A530084C06RikQ3UTW2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A530084C06RikQ3UTW2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A530084C06RikQ3UTW2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A530084C06RikQ3UTW2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A530084C06RikQ3UTW2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A530084C06RikQ3UTW2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms