Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Mindy4Q3UQI9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mindy4Q3UQI9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mindy4Q3UQI9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mindy4Q3UQI9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Mindy4Q3UQI9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mindy4Q3UQI9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Mindy4Q3UQI9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mindy4Q3UQI9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mindy4Q3UQI9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Mindy4Q3UQI9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mindy4Q3UQI9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mindy4Q3UQI9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mindy4Q3UQI9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mindy4Q3UQI9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mindy4Q3UQI9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mindy4Q3UQI9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mindy4Q3UQI9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mindy4Q3UQI9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mindy4Q3UQI9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Mindy4Q3UQI9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mindy4Q3UQI9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mindy4Q3UQI9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mindy4Q3UQI9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mindy4Q3UQI9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mindy4Q3UQI9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mindy4Q3UQI9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mindy4Q3UQI9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mindy4Q3UQI9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mindy4Q3UQI9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mindy4Q3UQI9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mindy4Q3UQI9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mindy4Q3UQI9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mindy4Q3UQI9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mindy4Q3UQI9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mindy4Q3UQI9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mindy4Q3UQI9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mindy4Q3UQI9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mindy4Q3UQI9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mindy4Q3UQI9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mindy4Q3UQI9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mindy4Q3UQI9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mindy4Q3UQI9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mindy4Q3UQI9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mindy4Q3UQI9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mindy4Q3UQI9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mindy4Q3UQI9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Mindy4Q3UQI9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mindy4Q3UQI9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Mindy4Q3UQI9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mindy4Q3UQI9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mindy4Q3UQI9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mindy4Q3UQI9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mindy4Q3UQI9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mindy4Q3UQI9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mindy4Q3UQI9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mindy4Q3UQI9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mindy4Q3UQI9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mindy4Q3UQI9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mindy4Q3UQI9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mindy4Q3UQI9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mindy4Q3UQI9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Mindy4Q3UQI9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mindy4Q3UQI9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mindy4Q3UQI9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mindy4Q3UQI9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mindy4Q3UQI9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mindy4Q3UQI9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mindy4Q3UQI9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mindy4Q3UQI9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mindy4Q3UQI9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mindy4Q3UQI9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mindy4Q3UQI9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mindy4Q3UQI9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mindy4Q3UQI9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mindy4Q3UQI9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Mindy4Q3UQI9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Mindy4Q3UQI9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mindy4Q3UQI9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mindy4Q3UQI9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mindy4Q3UQI9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mindy4Q3UQI9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mindy4Q3UQI9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mindy4Q3UQI9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mindy4Q3UQI9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mindy4Q3UQI9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mindy4Q3UQI9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mindy4Q3UQI9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mindy4Q3UQI9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mindy4Q3UQI9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mindy4Q3UQI9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mindy4Q3UQI9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mindy4Q3UQI9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mindy4Q3UQI9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mindy4Q3UQI9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mindy4Q3UQI9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mindy4Q3UQI9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mindy4Q3UQI9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mindy4Q3UQI9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mindy4Q3UQI9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms