Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc34Q3UI66 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc34Q3UI66 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc34Q3UI66 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc34Q3UI66 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc34Q3UI66 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc34Q3UI66 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc34Q3UI66 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc34Q3UI66 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc34Q3UI66 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc34Q3UI66 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc34Q3UI66 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc34Q3UI66 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc34Q3UI66 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc34Q3UI66 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc34Q3UI66 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc34Q3UI66 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc34Q3UI66 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc34Q3UI66 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc34Q3UI66 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc34Q3UI66 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc34Q3UI66 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc34Q3UI66 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc34Q3UI66 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc34Q3UI66 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc34Q3UI66 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc34Q3UI66 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc34Q3UI66 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc34Q3UI66 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc34Q3UI66 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc34Q3UI66 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc34Q3UI66 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc34Q3UI66 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc34Q3UI66 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc34Q3UI66 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc34Q3UI66 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc34Q3UI66 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc34Q3UI66 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc34Q3UI66 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc34Q3UI66 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc34Q3UI66 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc34Q3UI66 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc34Q3UI66 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc34Q3UI66 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc34Q3UI66 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc34Q3UI66 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc34Q3UI66 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc34Q3UI66 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc34Q3UI66 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc34Q3UI66 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc34Q3UI66 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc34Q3UI66 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc34Q3UI66 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc34Q3UI66 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc34Q3UI66 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc34Q3UI66 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc34Q3UI66 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc34Q3UI66 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc34Q3UI66 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc34Q3UI66 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc34Q3UI66 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc34Q3UI66 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc34Q3UI66 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc34Q3UI66 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc34Q3UI66 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc34Q3UI66 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc34Q3UI66 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc34Q3UI66 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc34Q3UI66 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc34Q3UI66 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc34Q3UI66 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc34Q3UI66 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc34Q3UI66 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc34Q3UI66 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc34Q3UI66 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc34Q3UI66 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc34Q3UI66 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc34Q3UI66 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc34Q3UI66 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc34Q3UI66 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc34Q3UI66 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc34Q3UI66 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc34Q3UI66 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc34Q3UI66 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms