Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Yipf3Q3UDR8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Yipf3Q3UDR8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Yipf3Q3UDR8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Yipf3Q3UDR8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Yipf3Q3UDR8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Yipf3Q3UDR8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Yipf3Q3UDR8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Yipf3Q3UDR8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Yipf3Q3UDR8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Yipf3Q3UDR8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Yipf3Q3UDR8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Yipf3Q3UDR8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Yipf3Q3UDR8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Yipf3Q3UDR8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Yipf3Q3UDR8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Yipf3Q3UDR8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Yipf3Q3UDR8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Yipf3Q3UDR8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Yipf3Q3UDR8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Yipf3Q3UDR8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Yipf3Q3UDR8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Yipf3Q3UDR8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Yipf3Q3UDR8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Yipf3Q3UDR8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Yipf3Q3UDR8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Yipf3Q3UDR8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Yipf3Q3UDR8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Yipf3Q3UDR8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Yipf3Q3UDR8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Yipf3Q3UDR8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Yipf3Q3UDR8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Yipf3Q3UDR8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Yipf3Q3UDR8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Yipf3Q3UDR8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Yipf3Q3UDR8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Yipf3Q3UDR8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Yipf3Q3UDR8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Yipf3Q3UDR8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Yipf3Q3UDR8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Yipf3Q3UDR8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Yipf3Q3UDR8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Yipf3Q3UDR8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Yipf3Q3UDR8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Yipf3Q3UDR8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Yipf3Q3UDR8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Yipf3Q3UDR8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Yipf3Q3UDR8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Yipf3Q3UDR8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Yipf3Q3UDR8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Yipf3Q3UDR8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Yipf3Q3UDR8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Yipf3Q3UDR8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Yipf3Q3UDR8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Yipf3Q3UDR8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Yipf3Q3UDR8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Yipf3Q3UDR8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Yipf3Q3UDR8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Yipf3Q3UDR8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Yipf3Q3UDR8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Yipf3Q3UDR8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Yipf3Q3UDR8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Yipf3Q3UDR8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Yipf3Q3UDR8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Yipf3Q3UDR8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Yipf3Q3UDR8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Yipf3Q3UDR8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Yipf3Q3UDR8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Yipf3Q3UDR8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Yipf3Q3UDR8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Yipf3Q3UDR8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Yipf3Q3UDR8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Yipf3Q3UDR8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Yipf3Q3UDR8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Yipf3Q3UDR8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Yipf3Q3UDR8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Yipf3Q3UDR8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Yipf3Q3UDR8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Yipf3Q3UDR8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Yipf3Q3UDR8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Yipf3Q3UDR8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Yipf3Q3UDR8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Yipf3Q3UDR8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Yipf3Q3UDR8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Yipf3Q3UDR8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Yipf3Q3UDR8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Yipf3Q3UDR8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Yipf3Q3UDR8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Yipf3Q3UDR8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Yipf3Q3UDR8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Yipf3Q3UDR8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Yipf3Q3UDR8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Yipf3Q3UDR8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Yipf3Q3UDR8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Yipf3Q3UDR8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Yipf3Q3UDR8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Yipf3Q3UDR8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Yipf3Q3UDR8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms