Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gtpbp6Q3U6U5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Gtpbp6Q3U6U5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Gtpbp6Q3U6U5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Gtpbp6Q3U6U5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gtpbp6Q3U6U5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gtpbp6Q3U6U5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Gtpbp6Q3U6U5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Gtpbp6Q3U6U5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gtpbp6Q3U6U5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gtpbp6Q3U6U5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gtpbp6Q3U6U5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Gtpbp6Q3U6U5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Gtpbp6Q3U6U5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Gtpbp6Q3U6U5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Gtpbp6Q3U6U5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Gtpbp6Q3U6U5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Gtpbp6Q3U6U5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Gtpbp6Q3U6U5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gtpbp6Q3U6U5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gtpbp6Q3U6U5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gtpbp6Q3U6U5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Gtpbp6Q3U6U5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Gtpbp6Q3U6U5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Gtpbp6Q3U6U5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Gtpbp6Q3U6U5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Gtpbp6Q3U6U5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gtpbp6Q3U6U5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Gtpbp6Q3U6U5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gtpbp6Q3U6U5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gtpbp6Q3U6U5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gtpbp6Q3U6U5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gtpbp6Q3U6U5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Gtpbp6Q3U6U5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Gtpbp6Q3U6U5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Gtpbp6Q3U6U5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Gtpbp6Q3U6U5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Gtpbp6Q3U6U5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Gtpbp6Q3U6U5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Gtpbp6Q3U6U5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Gtpbp6Q3U6U5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gtpbp6Q3U6U5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gtpbp6Q3U6U5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Gtpbp6Q3U6U5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Gtpbp6Q3U6U5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Gtpbp6Q3U6U5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Gtpbp6Q3U6U5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Gtpbp6Q3U6U5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Gtpbp6Q3U6U5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Gtpbp6Q3U6U5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Gtpbp6Q3U6U5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Gtpbp6Q3U6U5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Gtpbp6Q3U6U5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gtpbp6Q3U6U5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Gtpbp6Q3U6U5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Gtpbp6Q3U6U5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Gtpbp6Q3U6U5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Gtpbp6Q3U6U5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Gtpbp6Q3U6U5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Gtpbp6Q3U6U5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gtpbp6Q3U6U5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Gtpbp6Q3U6U5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gtpbp6Q3U6U5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gtpbp6Q3U6U5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gtpbp6Q3U6U5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gtpbp6Q3U6U5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gtpbp6Q3U6U5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gtpbp6Q3U6U5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gtpbp6Q3U6U5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gtpbp6Q3U6U5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms