Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VwceQ3U515 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VwceQ3U515 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VwceQ3U515 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VwceQ3U515 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VwceQ3U515 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VwceQ3U515 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VwceQ3U515 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VwceQ3U515 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VwceQ3U515 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VwceQ3U515 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VwceQ3U515 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VwceQ3U515 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VwceQ3U515 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VwceQ3U515 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VwceQ3U515 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VwceQ3U515 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VwceQ3U515 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VwceQ3U515 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VwceQ3U515 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VwceQ3U515 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VwceQ3U515 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VwceQ3U515 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VwceQ3U515 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VwceQ3U515 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VwceQ3U515 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VwceQ3U515 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VwceQ3U515 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VwceQ3U515 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VwceQ3U515 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VwceQ3U515 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VwceQ3U515 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VwceQ3U515 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VwceQ3U515 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VwceQ3U515 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VwceQ3U515 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VwceQ3U515 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VwceQ3U515 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VwceQ3U515 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VwceQ3U515 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VwceQ3U515 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VwceQ3U515 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VwceQ3U515 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VwceQ3U515 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VwceQ3U515 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VwceQ3U515 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VwceQ3U515 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VwceQ3U515 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VwceQ3U515 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VwceQ3U515 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VwceQ3U515 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VwceQ3U515 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VwceQ3U515 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VwceQ3U515 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VwceQ3U515 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VwceQ3U515 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VwceQ3U515 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VwceQ3U515 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VwceQ3U515 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VwceQ3U515 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VwceQ3U515 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VwceQ3U515 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VwceQ3U515 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VwceQ3U515 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VwceQ3U515 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VwceQ3U515 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VwceQ3U515 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VwceQ3U515 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VwceQ3U515 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VwceQ3U515 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VwceQ3U515 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VwceQ3U515 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VwceQ3U515 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VwceQ3U515 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VwceQ3U515 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VwceQ3U515 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VwceQ3U515 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VwceQ3U515 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VwceQ3U515 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VwceQ3U515 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VwceQ3U515 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VwceQ3U515 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VwceQ3U515 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VwceQ3U515 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VwceQ3U515 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VwceQ3U515 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VwceQ3U515 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VwceQ3U515 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VwceQ3U515 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VwceQ3U515 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VwceQ3U515 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VwceQ3U515 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VwceQ3U515 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VwceQ3U515 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VwceQ3U515 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VwceQ3U515 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VwceQ3U515 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VwceQ3U515 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VwceQ3U515 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VwceQ3U515 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms