Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrn4clQ3TYX2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrn4clQ3TYX2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrn4clQ3TYX2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrn4clQ3TYX2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrn4clQ3TYX2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrn4clQ3TYX2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrn4clQ3TYX2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn4clQ3TYX2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn4clQ3TYX2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrn4clQ3TYX2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrn4clQ3TYX2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrn4clQ3TYX2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrn4clQ3TYX2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrn4clQ3TYX2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrn4clQ3TYX2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrn4clQ3TYX2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrn4clQ3TYX2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrn4clQ3TYX2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms