Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrn4clQ3TYX2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrn4clQ3TYX2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrn4clQ3TYX2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrn4clQ3TYX2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrn4clQ3TYX2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrn4clQ3TYX2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrn4clQ3TYX2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrn4clQ3TYX2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrn4clQ3TYX2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrn4clQ3TYX2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrn4clQ3TYX2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrn4clQ3TYX2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrn4clQ3TYX2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrn4clQ3TYX2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrn4clQ3TYX2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn4clQ3TYX2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn4clQ3TYX2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrn4clQ3TYX2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrn4clQ3TYX2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrn4clQ3TYX2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrn4clQ3TYX2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrn4clQ3TYX2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrn4clQ3TYX2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrn4clQ3TYX2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrn4clQ3TYX2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrn4clQ3TYX2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrn4clQ3TYX2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms