Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam107bQ3TGF2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam107bQ3TGF2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam107bQ3TGF2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam107bQ3TGF2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam107bQ3TGF2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam107bQ3TGF2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam107bQ3TGF2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam107bQ3TGF2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam107bQ3TGF2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam107bQ3TGF2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam107bQ3TGF2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam107bQ3TGF2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam107bQ3TGF2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam107bQ3TGF2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam107bQ3TGF2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam107bQ3TGF2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam107bQ3TGF2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam107bQ3TGF2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam107bQ3TGF2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam107bQ3TGF2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam107bQ3TGF2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam107bQ3TGF2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam107bQ3TGF2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Fam107bQ3TGF2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam107bQ3TGF2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam107bQ3TGF2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam107bQ3TGF2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam107bQ3TGF2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam107bQ3TGF2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam107bQ3TGF2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam107bQ3TGF2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam107bQ3TGF2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam107bQ3TGF2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam107bQ3TGF2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam107bQ3TGF2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam107bQ3TGF2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam107bQ3TGF2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam107bQ3TGF2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam107bQ3TGF2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam107bQ3TGF2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam107bQ3TGF2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam107bQ3TGF2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam107bQ3TGF2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam107bQ3TGF2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam107bQ3TGF2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam107bQ3TGF2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam107bQ3TGF2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam107bQ3TGF2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam107bQ3TGF2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam107bQ3TGF2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam107bQ3TGF2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam107bQ3TGF2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam107bQ3TGF2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam107bQ3TGF2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam107bQ3TGF2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam107bQ3TGF2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam107bQ3TGF2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam107bQ3TGF2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam107bQ3TGF2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Fam107bQ3TGF2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam107bQ3TGF2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fam107bQ3TGF2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam107bQ3TGF2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam107bQ3TGF2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam107bQ3TGF2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam107bQ3TGF2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam107bQ3TGF2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam107bQ3TGF2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam107bQ3TGF2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam107bQ3TGF2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fam107bQ3TGF2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam107bQ3TGF2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam107bQ3TGF2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam107bQ3TGF2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam107bQ3TGF2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam107bQ3TGF2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam107bQ3TGF2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam107bQ3TGF2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam107bQ3TGF2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam107bQ3TGF2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam107bQ3TGF2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam107bQ3TGF2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam107bQ3TGF2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam107bQ3TGF2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam107bQ3TGF2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam107bQ3TGF2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam107bQ3TGF2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam107bQ3TGF2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam107bQ3TGF2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam107bQ3TGF2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam107bQ3TGF2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam107bQ3TGF2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam107bQ3TGF2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam107bQ3TGF2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam107bQ3TGF2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam107bQ3TGF2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam107bQ3TGF2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam107bQ3TGF2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam107bQ3TGF2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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