Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccbe1Q3MI99 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccbe1Q3MI99 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccbe1Q3MI99 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccbe1Q3MI99 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccbe1Q3MI99 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccbe1Q3MI99 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccbe1Q3MI99 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccbe1Q3MI99 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccbe1Q3MI99 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccbe1Q3MI99 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccbe1Q3MI99 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccbe1Q3MI99 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccbe1Q3MI99 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccbe1Q3MI99 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccbe1Q3MI99 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccbe1Q3MI99 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccbe1Q3MI99 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccbe1Q3MI99 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccbe1Q3MI99 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccbe1Q3MI99 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccbe1Q3MI99 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccbe1Q3MI99 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccbe1Q3MI99 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccbe1Q3MI99 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccbe1Q3MI99 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccbe1Q3MI99 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccbe1Q3MI99 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccbe1Q3MI99 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccbe1Q3MI99 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccbe1Q3MI99 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccbe1Q3MI99 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccbe1Q3MI99 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccbe1Q3MI99 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccbe1Q3MI99 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccbe1Q3MI99 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccbe1Q3MI99 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccbe1Q3MI99 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccbe1Q3MI99 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccbe1Q3MI99 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccbe1Q3MI99 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccbe1Q3MI99 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccbe1Q3MI99 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccbe1Q3MI99 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccbe1Q3MI99 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccbe1Q3MI99 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccbe1Q3MI99 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccbe1Q3MI99 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccbe1Q3MI99 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccbe1Q3MI99 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccbe1Q3MI99 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccbe1Q3MI99 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccbe1Q3MI99 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccbe1Q3MI99 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccbe1Q3MI99 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccbe1Q3MI99 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccbe1Q3MI99 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccbe1Q3MI99 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccbe1Q3MI99 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccbe1Q3MI99 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccbe1Q3MI99 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccbe1Q3MI99 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccbe1Q3MI99 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccbe1Q3MI99 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccbe1Q3MI99 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccbe1Q3MI99 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccbe1Q3MI99 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccbe1Q3MI99 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccbe1Q3MI99 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccbe1Q3MI99 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccbe1Q3MI99 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccbe1Q3MI99 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccbe1Q3MI99 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccbe1Q3MI99 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccbe1Q3MI99 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccbe1Q3MI99 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccbe1Q3MI99 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccbe1Q3MI99 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccbe1Q3MI99 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccbe1Q3MI99 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccbe1Q3MI99 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccbe1Q3MI99 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccbe1Q3MI99 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms