Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Treml4Q3LRV9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Treml4Q3LRV9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Treml4Q3LRV9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Treml4Q3LRV9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Treml4Q3LRV9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Treml4Q3LRV9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Treml4Q3LRV9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Treml4Q3LRV9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Treml4Q3LRV9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Treml4Q3LRV9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Treml4Q3LRV9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Treml4Q3LRV9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Treml4Q3LRV9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Treml4Q3LRV9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Treml4Q3LRV9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Treml4Q3LRV9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Treml4Q3LRV9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Treml4Q3LRV9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Treml4Q3LRV9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Treml4Q3LRV9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Treml4Q3LRV9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Treml4Q3LRV9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Treml4Q3LRV9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Treml4Q3LRV9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Treml4Q3LRV9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Treml4Q3LRV9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Treml4Q3LRV9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Treml4Q3LRV9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Treml4Q3LRV9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Treml4Q3LRV9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Treml4Q3LRV9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Treml4Q3LRV9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Treml4Q3LRV9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Treml4Q3LRV9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Treml4Q3LRV9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Treml4Q3LRV9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Treml4Q3LRV9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Treml4Q3LRV9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Treml4Q3LRV9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Treml4Q3LRV9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Treml4Q3LRV9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Treml4Q3LRV9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Treml4Q3LRV9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Treml4Q3LRV9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Treml4Q3LRV9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Treml4Q3LRV9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Treml4Q3LRV9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Treml4Q3LRV9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Treml4Q3LRV9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Treml4Q3LRV9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Treml4Q3LRV9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Treml4Q3LRV9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Treml4Q3LRV9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Treml4Q3LRV9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Treml4Q3LRV9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Treml4Q3LRV9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Treml4Q3LRV9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Treml4Q3LRV9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Treml4Q3LRV9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Treml4Q3LRV9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Treml4Q3LRV9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Treml4Q3LRV9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Treml4Q3LRV9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Treml4Q3LRV9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Treml4Q3LRV9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Treml4Q3LRV9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Treml4Q3LRV9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Treml4Q3LRV9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Treml4Q3LRV9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Treml4Q3LRV9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Treml4Q3LRV9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Treml4Q3LRV9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Treml4Q3LRV9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Treml4Q3LRV9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Treml4Q3LRV9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Treml4Q3LRV9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Treml4Q3LRV9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Treml4Q3LRV9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Treml4Q3LRV9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Treml4Q3LRV9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Treml4Q3LRV9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Treml4Q3LRV9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Treml4Q3LRV9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Treml4Q3LRV9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Treml4Q3LRV9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Treml4Q3LRV9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Treml4Q3LRV9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Treml4Q3LRV9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Treml4Q3LRV9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Treml4Q3LRV9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Treml4Q3LRV9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Treml4Q3LRV9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Treml4Q3LRV9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Treml4Q3LRV9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Treml4Q3LRV9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Treml4Q3LRV9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Treml4Q3LRV9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Treml4Q3LRV9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Treml4Q3LRV9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms