Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrriq3Q14DL3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq3Q14DL3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrriq3Q14DL3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq3Q14DL3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq3Q14DL3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq3Q14DL3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq3Q14DL3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrriq3Q14DL3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrriq3Q14DL3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrriq3Q14DL3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrriq3Q14DL3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrriq3Q14DL3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrriq3Q14DL3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrriq3Q14DL3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrriq3Q14DL3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrriq3Q14DL3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrriq3Q14DL3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrriq3Q14DL3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrriq3Q14DL3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrriq3Q14DL3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrriq3Q14DL3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrriq3Q14DL3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrriq3Q14DL3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrriq3Q14DL3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrriq3Q14DL3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrriq3Q14DL3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrriq3Q14DL3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrriq3Q14DL3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrriq3Q14DL3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrriq3Q14DL3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrriq3Q14DL3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrriq3Q14DL3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrriq3Q14DL3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrriq3Q14DL3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrriq3Q14DL3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrriq3Q14DL3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrriq3Q14DL3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrriq3Q14DL3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrriq3Q14DL3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrriq3Q14DL3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrriq3Q14DL3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrriq3Q14DL3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrriq3Q14DL3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrriq3Q14DL3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrriq3Q14DL3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrriq3Q14DL3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrriq3Q14DL3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrriq3Q14DL3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrriq3Q14DL3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrriq3Q14DL3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrriq3Q14DL3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrriq3Q14DL3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrriq3Q14DL3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrriq3Q14DL3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrriq3Q14DL3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrriq3Q14DL3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrriq3Q14DL3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrriq3Q14DL3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrriq3Q14DL3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrriq3Q14DL3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrriq3Q14DL3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrriq3Q14DL3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrriq3Q14DL3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrriq3Q14DL3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrriq3Q14DL3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrriq3Q14DL3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrriq3Q14DL3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrriq3Q14DL3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrriq3Q14DL3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrriq3Q14DL3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrriq3Q14DL3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrriq3Q14DL3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrriq3Q14DL3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrriq3Q14DL3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrriq3Q14DL3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrriq3Q14DL3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrriq3Q14DL3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrriq3Q14DL3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrriq3Q14DL3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrriq3Q14DL3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrriq3Q14DL3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrriq3Q14DL3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrriq3Q14DL3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrriq3Q14DL3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrriq3Q14DL3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrriq3Q14DL3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrriq3Q14DL3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrriq3Q14DL3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrriq3Q14DL3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrriq3Q14DL3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrriq3Q14DL3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrriq3Q14DL3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrriq3Q14DL3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrriq3Q14DL3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrriq3Q14DL3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrriq3Q14DL3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrriq3Q14DL3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrriq3Q14DL3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrriq3Q14DL3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms