Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Neurl1bQ0MW30 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Neurl1bQ0MW30 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Neurl1bQ0MW30 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Neurl1bQ0MW30 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Neurl1bQ0MW30 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Neurl1bQ0MW30 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Neurl1bQ0MW30 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Neurl1bQ0MW30 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Neurl1bQ0MW30 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Neurl1bQ0MW30 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Neurl1bQ0MW30 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Neurl1bQ0MW30 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Neurl1bQ0MW30 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Neurl1bQ0MW30 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Neurl1bQ0MW30 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Neurl1bQ0MW30 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Neurl1bQ0MW30 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Neurl1bQ0MW30 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Neurl1bQ0MW30 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Neurl1bQ0MW30 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Neurl1bQ0MW30 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Neurl1bQ0MW30 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Neurl1bQ0MW30 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Neurl1bQ0MW30 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Neurl1bQ0MW30 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Neurl1bQ0MW30 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Neurl1bQ0MW30 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Neurl1bQ0MW30 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Neurl1bQ0MW30 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Neurl1bQ0MW30 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Neurl1bQ0MW30 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Neurl1bQ0MW30 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Neurl1bQ0MW30 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Neurl1bQ0MW30 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Neurl1bQ0MW30 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Neurl1bQ0MW30 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Neurl1bQ0MW30 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Neurl1bQ0MW30 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Neurl1bQ0MW30 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Neurl1bQ0MW30 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Neurl1bQ0MW30 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Neurl1bQ0MW30 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Neurl1bQ0MW30 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Neurl1bQ0MW30 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Neurl1bQ0MW30 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Neurl1bQ0MW30 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Neurl1bQ0MW30 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neurl1bQ0MW30 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neurl1bQ0MW30 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Neurl1bQ0MW30 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Neurl1bQ0MW30 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Neurl1bQ0MW30 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Neurl1bQ0MW30 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Neurl1bQ0MW30 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neurl1bQ0MW30 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurl1bQ0MW30 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurl1bQ0MW30 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurl1bQ0MW30 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurl1bQ0MW30 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Neurl1bQ0MW30 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Neurl1bQ0MW30 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neurl1bQ0MW30 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neurl1bQ0MW30 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Neurl1bQ0MW30 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Neurl1bQ0MW30 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Neurl1bQ0MW30 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Neurl1bQ0MW30 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Neurl1bQ0MW30 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Neurl1bQ0MW30 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Neurl1bQ0MW30 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Neurl1bQ0MW30 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Neurl1bQ0MW30 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Neurl1bQ0MW30 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Neurl1bQ0MW30 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Neurl1bQ0MW30 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Neurl1bQ0MW30 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Neurl1bQ0MW30 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Neurl1bQ0MW30 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Neurl1bQ0MW30 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Neurl1bQ0MW30 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Neurl1bQ0MW30 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Neurl1bQ0MW30 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Neurl1bQ0MW30 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Neurl1bQ0MW30 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Neurl1bQ0MW30 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Neurl1bQ0MW30 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Neurl1bQ0MW30 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Neurl1bQ0MW30 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Neurl1bQ0MW30 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Neurl1bQ0MW30 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Neurl1bQ0MW30 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Neurl1bQ0MW30 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Neurl1bQ0MW30 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Neurl1bQ0MW30 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Neurl1bQ0MW30 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Neurl1bQ0MW30 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Neurl1bQ0MW30 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Neurl1bQ0MW30 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Neurl1bQ0MW30 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms