Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nfe2Q07279 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nfe2Q07279 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nfe2Q07279 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nfe2Q07279 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nfe2Q07279 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nfe2Q07279 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nfe2Q07279 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nfe2Q07279 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nfe2Q07279 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nfe2Q07279 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Nfe2Q07279 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nfe2Q07279 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nfe2Q07279 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nfe2Q07279 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nfe2Q07279 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nfe2Q07279 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nfe2Q07279 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nfe2Q07279 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nfe2Q07279 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nfe2Q07279 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nfe2Q07279 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nfe2Q07279 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nfe2Q07279 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nfe2Q07279 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nfe2Q07279 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nfe2Q07279 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nfe2Q07279 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nfe2Q07279 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nfe2Q07279 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Nfe2Q07279 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nfe2Q07279 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nfe2Q07279 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nfe2Q07279 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nfe2Q07279 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nfe2Q07279 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Nfe2Q07279 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nfe2Q07279 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nfe2Q07279 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nfe2Q07279 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nfe2Q07279 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nfe2Q07279 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nfe2Q07279 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nfe2Q07279 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nfe2Q07279 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nfe2Q07279 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Nfe2Q07279 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nfe2Q07279 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nfe2Q07279 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nfe2Q07279 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nfe2Q07279 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Nfe2Q07279 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nfe2Q07279 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nfe2Q07279 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nfe2Q07279 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nfe2Q07279 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nfe2Q07279 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nfe2Q07279 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nfe2Q07279 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nfe2Q07279 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nfe2Q07279 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nfe2Q07279 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Nfe2Q07279 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nfe2Q07279 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nfe2Q07279 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nfe2Q07279 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nfe2Q07279 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nfe2Q07279 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nfe2Q07279 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nfe2Q07279 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nfe2Q07279 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nfe2Q07279 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nfe2Q07279 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nfe2Q07279 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nfe2Q07279 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nfe2Q07279 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nfe2Q07279 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nfe2Q07279 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nfe2Q07279 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nfe2Q07279 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nfe2Q07279 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nfe2Q07279 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nfe2Q07279 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nfe2Q07279 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nfe2Q07279 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nfe2Q07279 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nfe2Q07279 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nfe2Q07279 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nfe2Q07279 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nfe2Q07279 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nfe2Q07279 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nfe2Q07279 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nfe2Q07279 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nfe2Q07279 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nfe2Q07279 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nfe2Q07279 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nfe2Q07279 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nfe2Q07279 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nfe2Q07279 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nfe2Q07279 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms