Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atf4Q06507 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf4Q06507 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf4Q06507 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf4Q06507 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf4Q06507 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf4Q06507 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf4Q06507 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf4Q06507 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf4Q06507 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf4Q06507 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf4Q06507 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf4Q06507 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf4Q06507 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf4Q06507 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf4Q06507 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf4Q06507 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf4Q06507 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf4Q06507 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf4Q06507 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf4Q06507 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf4Q06507 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf4Q06507 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf4Q06507 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf4Q06507 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf4Q06507 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atf4Q06507 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf4Q06507 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf4Q06507 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf4Q06507 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf4Q06507 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf4Q06507 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf4Q06507 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf4Q06507 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf4Q06507 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf4Q06507 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf4Q06507 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf4Q06507 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf4Q06507 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf4Q06507 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf4Q06507 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf4Q06507 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf4Q06507 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf4Q06507 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf4Q06507 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf4Q06507 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf4Q06507 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf4Q06507 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf4Q06507 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf4Q06507 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf4Q06507 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf4Q06507 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf4Q06507 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf4Q06507 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf4Q06507 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf4Q06507 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf4Q06507 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf4Q06507 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf4Q06507 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf4Q06507 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atf4Q06507 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf4Q06507 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf4Q06507 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf4Q06507 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf4Q06507 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf4Q06507 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf4Q06507 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf4Q06507 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf4Q06507 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf4Q06507 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf4Q06507 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf4Q06507 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf4Q06507 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf4Q06507 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf4Q06507 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf4Q06507 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf4Q06507 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atf4Q06507 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf4Q06507 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf4Q06507 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf4Q06507 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf4Q06507 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf4Q06507 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf4Q06507 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf4Q06507 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf4Q06507 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf4Q06507 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf4Q06507 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf4Q06507 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf4Q06507 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atf4Q06507 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf4Q06507 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atf4Q06507 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atf4Q06507 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atf4Q06507 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf4Q06507 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf4Q06507 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf4Q06507 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atf4Q06507 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atf4Q06507 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms