Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Sox12Q04890 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Sox12Q04890 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Sox12Q04890 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Sox12Q04890 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Sox12Q04890 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Sox12Q04890 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Sox12Q04890 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Sox12Q04890 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Sox12Q04890 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Sox12Q04890 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Sox12Q04890 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Sox12Q04890 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Sox12Q04890 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Sox12Q04890 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Sox12Q04890 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sox12Q04890 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Sox12Q04890 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Sox12Q04890 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Sox12Q04890 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Sox12Q04890 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Sox12Q04890 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Sox12Q04890 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Sox12Q04890 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Sox12Q04890 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Sox12Q04890 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Sox12Q04890 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Sox12Q04890 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Sox12Q04890 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Sox12Q04890 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Sox12Q04890 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Sox12Q04890 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Sox12Q04890 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Sox12Q04890 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Sox12Q04890 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Sox12Q04890 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Sox12Q04890 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sox12Q04890 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sox12Q04890 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sox12Q04890 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Sox12Q04890 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Sox12Q04890 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Sox12Q04890 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Sox12Q04890 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Sox12Q04890 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Sox12Q04890 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Sox12Q04890 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Sox12Q04890 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Sox12Q04890 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Sox12Q04890 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Sox12Q04890 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Sox12Q04890 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Sox12Q04890 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Sox12Q04890 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Sox12Q04890 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Sox12Q04890 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Sox12Q04890 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Sox12Q04890 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Sox12Q04890 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Sox12Q04890 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Sox12Q04890 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Sox12Q04890 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Sox12Q04890 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Sox12Q04890 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Sox12Q04890 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Sox12Q04890 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Sox12Q04890 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Sox12Q04890 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Sox12Q04890 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Sox12Q04890 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Sox12Q04890 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Sox12Q04890 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Sox12Q04890 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Sox12Q04890 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Sox12Q04890 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Sox12Q04890 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Sox12Q04890 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Sox12Q04890 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Sox12Q04890 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Sox12Q04890 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Sox12Q04890 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Sox12Q04890 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Sox12Q04890 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Sox12Q04890 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Sox12Q04890 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Sox12Q04890 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Sox12Q04890 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Sox12Q04890 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Sox12Q04890 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sox12Q04890 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Sox12Q04890 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Sox12Q04890 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Sox12Q04890 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Sox12Q04890 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Sox12Q04890 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Sox12Q04890 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Sox12Q04890 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Sox12Q04890 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Sox12Q04890 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Sox12Q04890 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms