Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sox9Q04887 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sox9Q04887 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox9Q04887 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sox9Q04887 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sox9Q04887 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sox9Q04887 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sox9Q04887 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sox9Q04887 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sox9Q04887 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sox9Q04887 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sox9Q04887 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sox9Q04887 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sox9Q04887 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sox9Q04887 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sox9Q04887 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sox9Q04887 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox9Q04887 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sox9Q04887 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sox9Q04887 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sox9Q04887 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox9Q04887 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sox9Q04887 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sox9Q04887 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sox9Q04887 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sox9Q04887 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sox9Q04887 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sox9Q04887 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sox9Q04887 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sox9Q04887 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sox9Q04887 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sox9Q04887 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sox9Q04887 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sox9Q04887 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sox9Q04887 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox9Q04887 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sox9Q04887 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sox9Q04887 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sox9Q04887 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Sox9Q04887 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox9Q04887 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox9Q04887 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox9Q04887 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox9Q04887 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox9Q04887 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sox9Q04887 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sox9Q04887 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox9Q04887 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sox9Q04887 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sox9Q04887 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox9Q04887 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sox9Q04887 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sox9Q04887 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sox9Q04887 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sox9Q04887 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sox9Q04887 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sox9Q04887 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox9Q04887 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox9Q04887 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sox9Q04887 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox9Q04887 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sox9Q04887 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sox9Q04887 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox9Q04887 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox9Q04887 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sox9Q04887 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Sox9Q04887 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sox9Q04887 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sox9Q04887 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sox9Q04887 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox9Q04887 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox9Q04887 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sox9Q04887 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sox9Q04887 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sox9Q04887 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sox9Q04887 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox9Q04887 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sox9Q04887 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox9Q04887 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox9Q04887 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox9Q04887 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox9Q04887 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sox9Q04887 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sox9Q04887 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sox9Q04887 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox9Q04887 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox9Q04887 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox9Q04887 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox9Q04887 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox9Q04887 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox9Q04887 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox9Q04887 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox9Q04887 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox9Q04887 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox9Q04887 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sox9Q04887 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox9Q04887 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sox9Q04887 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox9Q04887 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox9Q04887 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms