Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hivep1Q03172 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hivep1Q03172 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hivep1Q03172 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hivep1Q03172 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hivep1Q03172 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hivep1Q03172 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hivep1Q03172 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hivep1Q03172 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hivep1Q03172 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hivep1Q03172 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hivep1Q03172 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hivep1Q03172 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hivep1Q03172 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hivep1Q03172 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hivep1Q03172 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hivep1Q03172 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hivep1Q03172 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hivep1Q03172 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hivep1Q03172 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hivep1Q03172 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hivep1Q03172 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hivep1Q03172 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hivep1Q03172 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hivep1Q03172 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hivep1Q03172 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hivep1Q03172 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hivep1Q03172 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hivep1Q03172 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hivep1Q03172 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hivep1Q03172 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hivep1Q03172 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hivep1Q03172 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hivep1Q03172 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hivep1Q03172 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hivep1Q03172 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hivep1Q03172 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hivep1Q03172 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hivep1Q03172 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hivep1Q03172 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hivep1Q03172 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hivep1Q03172 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hivep1Q03172 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hivep1Q03172 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hivep1Q03172 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hivep1Q03172 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hivep1Q03172 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hivep1Q03172 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hivep1Q03172 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hivep1Q03172 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hivep1Q03172 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hivep1Q03172 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hivep1Q03172 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hivep1Q03172 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hivep1Q03172 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hivep1Q03172 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hivep1Q03172 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hivep1Q03172 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hivep1Q03172 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hivep1Q03172 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hivep1Q03172 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hivep1Q03172 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hivep1Q03172 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hivep1Q03172 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hivep1Q03172 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hivep1Q03172 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hivep1Q03172 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hivep1Q03172 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hivep1Q03172 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hivep1Q03172 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hivep1Q03172 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hivep1Q03172 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hivep1Q03172 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hivep1Q03172 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hivep1Q03172 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hivep1Q03172 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hivep1Q03172 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hivep1Q03172 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hivep1Q03172 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hivep1Q03172 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hivep1Q03172 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hivep1Q03172 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hivep1Q03172 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hivep1Q03172 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hivep1Q03172 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hivep1Q03172 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hivep1Q03172 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hivep1Q03172 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hivep1Q03172 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hivep1Q03172 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hivep1Q03172 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hivep1Q03172 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hivep1Q03172 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hivep1Q03172 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hivep1Q03172 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hivep1Q03172 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hivep1Q03172 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hivep1Q03172 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hivep1Q03172 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hivep1Q03172 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms