Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cacna1sQ02789 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cacna1sQ02789 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cacna1sQ02789 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cacna1sQ02789 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Cacna1sQ02789 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cacna1sQ02789 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Cacna1sQ02789 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Cacna1sQ02789 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cacna1sQ02789 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Cacna1sQ02789 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cacna1sQ02789 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cacna1sQ02789 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cacna1sQ02789 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cacna1sQ02789 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cacna1sQ02789 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cacna1sQ02789 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cacna1sQ02789 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cacna1sQ02789 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cacna1sQ02789 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cacna1sQ02789 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cacna1sQ02789 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cacna1sQ02789 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cacna1sQ02789 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cacna1sQ02789 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cacna1sQ02789 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cacna1sQ02789 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cacna1sQ02789 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cacna1sQ02789 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cacna1sQ02789 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cacna1sQ02789 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cacna1sQ02789 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cacna1sQ02789 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cacna1sQ02789 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cacna1sQ02789 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cacna1sQ02789 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cacna1sQ02789 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cacna1sQ02789 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cacna1sQ02789 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cacna1sQ02789 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cacna1sQ02789 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cacna1sQ02789 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cacna1sQ02789 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cacna1sQ02789 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cacna1sQ02789 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cacna1sQ02789 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cacna1sQ02789 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cacna1sQ02789 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cacna1sQ02789 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Cacna1sQ02789 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Cacna1sQ02789 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cacna1sQ02789 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cacna1sQ02789 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cacna1sQ02789 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cacna1sQ02789 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cacna1sQ02789 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cacna1sQ02789 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cacna1sQ02789 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Cacna1sQ02789 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cacna1sQ02789 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cacna1sQ02789 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Cacna1sQ02789 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cacna1sQ02789 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Cacna1sQ02789 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cacna1sQ02789 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cacna1sQ02789 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cacna1sQ02789 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Cacna1sQ02789 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cacna1sQ02789 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cacna1sQ02789 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Cacna1sQ02789 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cacna1sQ02789 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cacna1sQ02789 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cacna1sQ02789 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cacna1sQ02789 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cacna1sQ02789 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Cacna1sQ02789 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cacna1sQ02789 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cacna1sQ02789 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cacna1sQ02789 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cacna1sQ02789 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cacna1sQ02789 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Cacna1sQ02789 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cacna1sQ02789 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cacna1sQ02789 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cacna1sQ02789 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cacna1sQ02789 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Cacna1sQ02789 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cacna1sQ02789 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cacna1sQ02789 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cacna1sQ02789 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cacna1sQ02789 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cacna1sQ02789 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cacna1sQ02789 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cacna1sQ02789 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cacna1sQ02789 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cacna1sQ02789 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cacna1sQ02789 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cacna1sQ02789 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Cacna1sQ02789 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms