Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NfiaQ02780 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NfiaQ02780 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NfiaQ02780 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NfiaQ02780 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NfiaQ02780 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NfiaQ02780 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NfiaQ02780 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NfiaQ02780 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NfiaQ02780 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NfiaQ02780 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NfiaQ02780 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NfiaQ02780 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NfiaQ02780 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NfiaQ02780 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NfiaQ02780 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NfiaQ02780 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NfiaQ02780 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NfiaQ02780 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NfiaQ02780 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NfiaQ02780 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NfiaQ02780 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NfiaQ02780 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NfiaQ02780 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NfiaQ02780 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NfiaQ02780 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NfiaQ02780 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NfiaQ02780 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NfiaQ02780 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NfiaQ02780 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NfiaQ02780 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NfiaQ02780 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NfiaQ02780 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NfiaQ02780 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NfiaQ02780 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NfiaQ02780 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NfiaQ02780 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NfiaQ02780 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NfiaQ02780 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NfiaQ02780 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NfiaQ02780 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NfiaQ02780 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NfiaQ02780 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NfiaQ02780 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NfiaQ02780 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NfiaQ02780 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NfiaQ02780 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NfiaQ02780 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NfiaQ02780 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NfiaQ02780 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NfiaQ02780 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NfiaQ02780 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NfiaQ02780 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NfiaQ02780 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NfiaQ02780 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NfiaQ02780 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NfiaQ02780 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NfiaQ02780 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NfiaQ02780 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NfiaQ02780 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NfiaQ02780 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NfiaQ02780 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NfiaQ02780 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NfiaQ02780 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NfiaQ02780 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NfiaQ02780 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NfiaQ02780 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NfiaQ02780 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NfiaQ02780 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NfiaQ02780 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NfiaQ02780 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NfiaQ02780 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NfiaQ02780 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NfiaQ02780 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NfiaQ02780 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NfiaQ02780 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NfiaQ02780 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NfiaQ02780 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NfiaQ02780 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NfiaQ02780 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NfiaQ02780 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NfiaQ02780 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NfiaQ02780 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NfiaQ02780 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NfiaQ02780 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NfiaQ02780 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms