Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
NfiaQ02780 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,06■■■□□ 2,4
NfiaQ02780 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,06■■■□□ 2,4
NfiaQ02780 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
NfiaQ02780 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
NfiaQ02780 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,02■■■□□ 2,4
NfiaQ02780 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
NfiaQ02780 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
NfiaQ02780 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
NfiaQ02780 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
NfiaQ02780 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
NfiaQ02780 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,95■■■□□ 2,39
NfiaQ02780 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
NfiaQ02780 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
NfiaQ02780 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,37
NfiaQ02780 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
NfiaQ02780 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,85■■■□□ 2,37
NfiaQ02780 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
NfiaQ02780 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
NfiaQ02780 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
NfiaQ02780 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
NfiaQ02780 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
NfiaQ02780 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
NfiaQ02780 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
NfiaQ02780 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
NfiaQ02780 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
NfiaQ02780 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
NfiaQ02780 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
NfiaQ02780 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
NfiaQ02780 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
NfiaQ02780 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
NfiaQ02780 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
NfiaQ02780 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
NfiaQ02780 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
NfiaQ02780 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
NfiaQ02780 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
NfiaQ02780 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
NfiaQ02780 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
NfiaQ02780 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
NfiaQ02780 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
NfiaQ02780 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
NfiaQ02780 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
NfiaQ02780 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
NfiaQ02780 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
NfiaQ02780 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
NfiaQ02780 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
NfiaQ02780 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
NfiaQ02780 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
NfiaQ02780 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
NfiaQ02780 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,51■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,46■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29,45■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
NfiaQ02780 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
NfiaQ02780 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
NfiaQ02780 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
NfiaQ02780 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,4■■■□□ 2,3
NfiaQ02780 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
NfiaQ02780 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
NfiaQ02780 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
NfiaQ02780 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
NfiaQ02780 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
NfiaQ02780 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
NfiaQ02780 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,33■■■□□ 2,29
NfiaQ02780 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,32■■■□□ 2,28
NfiaQ02780 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
NfiaQ02780 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
NfiaQ02780 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
NfiaQ02780 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
NfiaQ02780 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
NfiaQ02780 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29,24■■■□□ 2,27
NfiaQ02780 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
NfiaQ02780 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
NfiaQ02780 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
NfiaQ02780 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
NfiaQ02780 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
NfiaQ02780 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
NfiaQ02780 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
NfiaQ02780 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,16■■■□□ 2,26
NfiaQ02780 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,15■■■□□ 2,26
NfiaQ02780 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
NfiaQ02780 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
NfiaQ02780 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
NfiaQ02780 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29,11■■■□□ 2,25
NfiaQ02780 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
NfiaQ02780 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
NfiaQ02780 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
NfiaQ02780 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
NfiaQ02780 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48,9 ms