Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ly9Q01965 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ly9Q01965 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ly9Q01965 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ly9Q01965 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ly9Q01965 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ly9Q01965 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ly9Q01965 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ly9Q01965 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ly9Q01965 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ly9Q01965 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ly9Q01965 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ly9Q01965 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ly9Q01965 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ly9Q01965 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ly9Q01965 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ly9Q01965 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ly9Q01965 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ly9Q01965 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ly9Q01965 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ly9Q01965 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ly9Q01965 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ly9Q01965 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ly9Q01965 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ly9Q01965 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ly9Q01965 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ly9Q01965 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ly9Q01965 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ly9Q01965 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ly9Q01965 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ly9Q01965 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ly9Q01965 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ly9Q01965 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ly9Q01965 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ly9Q01965 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ly9Q01965 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ly9Q01965 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ly9Q01965 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ly9Q01965 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ly9Q01965 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ly9Q01965 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ly9Q01965 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ly9Q01965 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ly9Q01965 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ly9Q01965 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ly9Q01965 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ly9Q01965 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ly9Q01965 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ly9Q01965 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ly9Q01965 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ly9Q01965 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ly9Q01965 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ly9Q01965 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ly9Q01965 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ly9Q01965 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ly9Q01965 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ly9Q01965 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ly9Q01965 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ly9Q01965 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ly9Q01965 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ly9Q01965 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ly9Q01965 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ly9Q01965 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ly9Q01965 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ly9Q01965 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ly9Q01965 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ly9Q01965 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ly9Q01965 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ly9Q01965 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ly9Q01965 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ly9Q01965 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ly9Q01965 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ly9Q01965 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ly9Q01965 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ly9Q01965 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ly9Q01965 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ly9Q01965 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ly9Q01965 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ly9Q01965 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ly9Q01965 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ly9Q01965 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ly9Q01965 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ly9Q01965 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ly9Q01965 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ly9Q01965 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ly9Q01965 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ly9Q01965 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ly9Q01965 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ly9Q01965 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ly9Q01965 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ly9Q01965 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ly9Q01965 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ly9Q01965 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ly9Q01965 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ly9Q01965 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ly9Q01965 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ly9Q01965 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ly9Q01965 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ly9Q01965 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ly9Q01965 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms