Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Gja5Q01231 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Gja5Q01231 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Gja5Q01231 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Gja5Q01231 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Gja5Q01231 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Gja5Q01231 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Gja5Q01231 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Gja5Q01231 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Gja5Q01231 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Gja5Q01231 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Gja5Q01231 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Gja5Q01231 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Gja5Q01231 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Gja5Q01231 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Gja5Q01231 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Gja5Q01231 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Gja5Q01231 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Gja5Q01231 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gja5Q01231 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gja5Q01231 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Gja5Q01231 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gja5Q01231 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gja5Q01231 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gja5Q01231 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gja5Q01231 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gja5Q01231 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gja5Q01231 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Gja5Q01231 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Gja5Q01231 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gja5Q01231 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Gja5Q01231 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gja5Q01231 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gja5Q01231 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Gja5Q01231 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Gja5Q01231 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Gja5Q01231 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gja5Q01231 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gja5Q01231 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Gja5Q01231 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gja5Q01231 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gja5Q01231 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gja5Q01231 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Gja5Q01231 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Gja5Q01231 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gja5Q01231 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gja5Q01231 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gja5Q01231 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Gja5Q01231 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Gja5Q01231 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Gja5Q01231 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Gja5Q01231 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Gja5Q01231 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Gja5Q01231 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Gja5Q01231 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Gja5Q01231 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Gja5Q01231 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Gja5Q01231 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gja5Q01231 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gja5Q01231 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gja5Q01231 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Gja5Q01231 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Gja5Q01231 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Gja5Q01231 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gja5Q01231 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gja5Q01231 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gja5Q01231 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gja5Q01231 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gja5Q01231 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Gja5Q01231 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Gja5Q01231 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Gja5Q01231 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Gja5Q01231 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Gja5Q01231 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Gja5Q01231 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Gja5Q01231 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Gja5Q01231 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Gja5Q01231 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Gja5Q01231 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Gja5Q01231 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gja5Q01231 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gja5Q01231 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gja5Q01231 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Gja5Q01231 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Gja5Q01231 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gja5Q01231 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gja5Q01231 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gja5Q01231 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gja5Q01231 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gja5Q01231 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gja5Q01231 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Gja5Q01231 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Gja5Q01231 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Gja5Q01231 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Gja5Q01231 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gja5Q01231 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gja5Q01231 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gja5Q01231 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gja5Q01231 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gja5Q01231 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms