Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,03
Col1a2Q01149 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Col1a2Q01149 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Col1a2Q01149 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Col1a2Q01149 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Col1a2Q01149 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Col1a2Q01149 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,87■■■■□ 3,01
Col1a2Q01149 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Col1a2Q01149 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Col1a2Q01149 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Col1a2Q01149 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Col1a2Q01149 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Col1a2Q01149 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Col1a2Q01149 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Col1a2Q01149 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33,8■■■■□ 3
Col1a2Q01149 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Col1a2Q01149 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Col1a2Q01149 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Col1a2Q01149 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Col1a2Q01149 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Col1a2Q01149 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Col1a2Q01149 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Col1a2Q01149 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Col1a2Q01149 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Col1a2Q01149 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33,67■■■□□ 2,98
Col1a2Q01149 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Col1a2Q01149 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Col1a2Q01149 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Col1a2Q01149 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Col1a2Q01149 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Col1a2Q01149 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Col1a2Q01149 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,51■■■□□ 2,96
Col1a2Q01149 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
Col1a2Q01149 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Col1a2Q01149 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Col1a2Q01149 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Col1a2Q01149 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Col1a2Q01149 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Col1a2Q01149 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Col1a2Q01149 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Col1a2Q01149 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Col1a2Q01149 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Col1a2Q01149 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Col1a2Q01149 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Col1a2Q01149 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Col1a2Q01149 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33,34■■■□□ 2,93
Col1a2Q01149 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33,33■■■□□ 2,93
Col1a2Q01149 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33,28■■■□□ 2,92
Col1a2Q01149 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,26■■■□□ 2,92
Col1a2Q01149 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Col1a2Q01149 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Col1a2Q01149 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Col1a2Q01149 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Col1a2Q01149 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Col1a2Q01149 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Col1a2Q01149 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33,23■■■□□ 2,91
Col1a2Q01149 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Col1a2Q01149 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Col1a2Q01149 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Col1a2Q01149 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Col1a2Q01149 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Col1a2Q01149 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Col1a2Q01149 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33,18■■■□□ 2,9
Col1a2Q01149 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Col1a2Q01149 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Col1a2Q01149 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Col1a2Q01149 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Col1a2Q01149 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Col1a2Q01149 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Col1a2Q01149 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Col1a2Q01149 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Col1a2Q01149 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Col1a2Q01149 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Col1a2Q01149 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Col1a2Q01149 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Col1a2Q01149 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Col1a2Q01149 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Col1a2Q01149 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Col1a2Q01149 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Col1a2Q01149 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Col1a2Q01149 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
Col1a2Q01149 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33,01■■■□□ 2,88
Col1a2Q01149 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33,01■■■□□ 2,88
Col1a2Q01149 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Col1a2Q01149 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Col1a2Q01149 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Col1a2Q01149 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Col1a2Q01149 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Col1a2Q01149 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Col1a2Q01149 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Col1a2Q01149 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Col1a2Q01149 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Col1a2Q01149 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Col1a2Q01149 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Col1a2Q01149 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Col1a2Q01149 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Col1a2Q01149 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Col1a2Q01149 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Col1a2Q01149 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32,89■■■□□ 2,86
Col1a2Q01149 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms