Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atp1b3P97370 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Atp1b3P97370 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Atp1b3P97370 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Atp1b3P97370 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Atp1b3P97370 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Atp1b3P97370 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp1b3P97370 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp1b3P97370 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp1b3P97370 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atp1b3P97370 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atp1b3P97370 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Atp1b3P97370 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Atp1b3P97370 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Atp1b3P97370 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Atp1b3P97370 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Atp1b3P97370 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Atp1b3P97370 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atp1b3P97370 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Atp1b3P97370 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Atp1b3P97370 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Atp1b3P97370 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atp1b3P97370 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Atp1b3P97370 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Atp1b3P97370 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Atp1b3P97370 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Atp1b3P97370 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atp1b3P97370 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Atp1b3P97370 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Atp1b3P97370 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Atp1b3P97370 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atp1b3P97370 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atp1b3P97370 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Atp1b3P97370 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Atp1b3P97370 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Atp1b3P97370 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Atp1b3P97370 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Atp1b3P97370 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Atp1b3P97370 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Atp1b3P97370 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atp1b3P97370 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Atp1b3P97370 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Atp1b3P97370 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Atp1b3P97370 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Atp1b3P97370 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Atp1b3P97370 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Atp1b3P97370 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Atp1b3P97370 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Atp1b3P97370 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Atp1b3P97370 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Atp1b3P97370 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Atp1b3P97370 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Atp1b3P97370 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Atp1b3P97370 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Atp1b3P97370 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Atp1b3P97370 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Atp1b3P97370 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Atp1b3P97370 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Atp1b3P97370 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atp1b3P97370 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Atp1b3P97370 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Atp1b3P97370 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Atp1b3P97370 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Atp1b3P97370 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Atp1b3P97370 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Atp1b3P97370 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Atp1b3P97370 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Atp1b3P97370 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Atp1b3P97370 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Atp1b3P97370 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Atp1b3P97370 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Atp1b3P97370 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Atp1b3P97370 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Atp1b3P97370 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Atp1b3P97370 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Atp1b3P97370 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Atp1b3P97370 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Atp1b3P97370 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Atp1b3P97370 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Atp1b3P97370 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Atp1b3P97370 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Atp1b3P97370 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Atp1b3P97370 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Atp1b3P97370 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Atp1b3P97370 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Atp1b3P97370 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Atp1b3P97370 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Atp1b3P97370 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Atp1b3P97370 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atp1b3P97370 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atp1b3P97370 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Atp1b3P97370 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Atp1b3P97370 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atp1b3P97370 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atp1b3P97370 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atp1b3P97370 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Atp1b3P97370 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Atp1b3P97370 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atp1b3P97370 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atp1b3P97370 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms