Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SmsP97355 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SmsP97355 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SmsP97355 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SmsP97355 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SmsP97355 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SmsP97355 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SmsP97355 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SmsP97355 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SmsP97355 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SmsP97355 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SmsP97355 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SmsP97355 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SmsP97355 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SmsP97355 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SmsP97355 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SmsP97355 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SmsP97355 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SmsP97355 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SmsP97355 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SmsP97355 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SmsP97355 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SmsP97355 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SmsP97355 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SmsP97355 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SmsP97355 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SmsP97355 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SmsP97355 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SmsP97355 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SmsP97355 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SmsP97355 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SmsP97355 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SmsP97355 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SmsP97355 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SmsP97355 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SmsP97355 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SmsP97355 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SmsP97355 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SmsP97355 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SmsP97355 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SmsP97355 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SmsP97355 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SmsP97355 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SmsP97355 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SmsP97355 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SmsP97355 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SmsP97355 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SmsP97355 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SmsP97355 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SmsP97355 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SmsP97355 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SmsP97355 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SmsP97355 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SmsP97355 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SmsP97355 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SmsP97355 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SmsP97355 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SmsP97355 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SmsP97355 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SmsP97355 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SmsP97355 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SmsP97355 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SmsP97355 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SmsP97355 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SmsP97355 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SmsP97355 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SmsP97355 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SmsP97355 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SmsP97355 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SmsP97355 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SmsP97355 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SmsP97355 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SmsP97355 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SmsP97355 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SmsP97355 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SmsP97355 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SmsP97355 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SmsP97355 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SmsP97355 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SmsP97355 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SmsP97355 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SmsP97355 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SmsP97355 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SmsP97355 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SmsP97355 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SmsP97355 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SmsP97355 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SmsP97355 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SmsP97355 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SmsP97355 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SmsP97355 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SmsP97355 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SmsP97355 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SmsP97355 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SmsP97355 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SmsP97355 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SmsP97355 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SmsP97355 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SmsP97355 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SmsP97355 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms